More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1222 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1222  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  534  1e-151  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0088  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  55.84 
 
 		 266 aa  276  3e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2378  alanine racemase domain protein  44 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10850  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  42.29 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.384201  normal  0.913003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  42.32 
 
 		 230 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1178  alanine racemase domain protein  41.41 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  normal  0.161066 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  40.73 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  41.5 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  39.21 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  39.29 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  36.76 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  38 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  37.6 
 
 		 243 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  39.68 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  37.15 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  35.32 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  37.99 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  34.51 
 
 		 253 aa  142  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  36.4 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  36 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  36.29 
 
 		 225 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  37.6 
 
 		 232 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  36.11 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0758  hypothetical protein  37.17 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  37.07 
 
 		 257 aa  139  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  34.52 
 
 		 230 aa  139  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  36.22 
 
 		 236 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  38.1 
 
 		 231 aa  138  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  35.6 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  35.19 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  34.13 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  34.13 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  36.51 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08000  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  43.1 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0412796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  36.51 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  34.13 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  33.99 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  35.62 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  34.38 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  33.87 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  34.13 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  34.52 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  37.5 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  35.34 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  37.71 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  36.82 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  33.99 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  35.86 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  35.6 
 
 		 227 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  33.46 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0685  alanine racemase domain-containing protein  36.89 
 
 		 220 aa  132  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.268017  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  37.08 
 
 		 229 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_664  alanine racemase domain protein  37.17 
 
 		 220 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0827888  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  35.19 
 
 		 228 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  35.22 
 
 		 224 aa  132  7.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  35.6 
 
 		 228 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  32.4 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  32.81 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  35.46 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  34.65 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  39.01 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  35.36 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  34.26 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  36.11 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  36.51 
 
 		 228 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  34.13 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  34.16 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  37.11 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  35.18 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  37.74 
 
 		 235 aa  129  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  31.89 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  37.97 
 
 		 248 aa  128  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  31.98 
 
 		 229 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  31.98 
 
 		 229 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2190  hypothetical cytosolic protein  32 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.724398  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  35.95 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  33.2 
 
 		 234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  37.07 
 
 		 229 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2216  hypothetical protein  32 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000309161  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  35.32 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  33.88 
 
 		 228 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  35.8 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  32.54 
 
 		 255 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  37.74 
 
 		 244 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  33.73 
 
 		 229 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1699  alanine racemase domain protein  34.98 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.021514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  35.86 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  32.13 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  33.2 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  34.71 
 
 		 270 aa  125  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  35.41 
 
 		 239 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  35.6 
 
 		 229 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  40.43 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  32.4 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  34.13 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  36.33 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  31.43 
 
 		 228 aa  123  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  32.79 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  32.27 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  35.71 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>