More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_664 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_664  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0827888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0758  hypothetical protein  86.82 
 
 		 220 aa  400  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28716  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0685  alanine racemase domain-containing protein  90 
 
 		 220 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.268017  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  52.31 
 
 		 218 aa  231  6e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  42.65 
 
 		 227 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  42.35 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  38.24 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  41.38 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  42.71 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  38.27 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  38.92 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  38.42 
 
 		 228 aa  148  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  38.28 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  40.49 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  35.27 
 
 		 236 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  33.92 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  38.71 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  37.33 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  37.32 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  38.12 
 
 		 275 aa  143  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  39.51 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  35.75 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  36.8 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  37.67 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  39.3 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  37.32 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  43.48 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  43.41 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  39.22 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  35.96 
 
 		 237 aa  138  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  39.9 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  38.83 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  40.1 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2299  hypothetical protein  38.97 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.770336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  38.73 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  39.81 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  37.25 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  37.14 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  39.23 
 
 		 243 aa  134  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  37.44 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  37.33 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  35.86 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  34.62 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  39.9 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  36.1 
 
 		 235 aa  132  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  36.99 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  39.22 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  36.27 
 
 		 244 aa  131  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  39.81 
 
 		 242 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  39.22 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  39.2 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  38.1 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1222  hypothetical protein  36.73 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  34.63 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  38.58 
 
 		 244 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  38.07 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  32.57 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40339  predicted protein  41.18 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  43.2 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  37.38 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  37.02 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  34.4 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  35.43 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  43.43 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  40.57 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  37.38 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  37.88 
 
 		 271 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  39.41 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  36.07 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  36.49 
 
 		 241 aa  124  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  31.8 
 
 		 219 aa  124  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  39.72 
 
 		 236 aa  124  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  32.43 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  34.33 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  37.69 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  39.73 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  34.74 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  37.56 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  39.61 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  33.83 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  38.24 
 
 		 269 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  35.47 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  40.2 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  36.95 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  39.89 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  36.95 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  33.83 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  33.83 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  33.83 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  39.7 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  33.83 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  33.83 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  33.65 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  34.09 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  35.1 
 
 		 249 aa  121  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  35.68 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  36.24 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  38.94 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>