More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1539 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  59.29 
 
 		 235 aa  272  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  56.16 
 
 		 231 aa  254  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  51.85 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  51.85 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  45.62 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  46.51 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  43.07 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  46.53 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  43.05 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  44.39 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  43.75 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  45.41 
 
 		 225 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  44.66 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  43.96 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  41.3 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  43.46 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  44.44 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  45.67 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  42.86 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  39.21 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  41.36 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  42.41 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  40.93 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  41.98 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  43.84 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  47.3 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09440  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.22 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000968769  normal  0.0803306 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  41.4 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  38.24 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  41.33 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  38.74 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  38.46 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  41.5 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  37.79 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  41.5 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  39.26 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  42.93 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  37.79 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  41 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  36.41 
 
 		 271 aa  158  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  40.87 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  39.07 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  42.42 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  39.81 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  40.74 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  43.07 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  37.39 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  39.2 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  39.11 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  41.86 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1272  alanine racemase domain-containing protein  42.93 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000279227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  41.86 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  40.91 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1247  alanine racemase domain-containing protein  42.93 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000447038  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  37.84 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  40.85 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  39.02 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  44.02 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  42.66 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  37.25 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  44.16 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  36.12 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  37.09 
 
 		 234 aa  151  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  38.67 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  38.71 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  38.53 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  40.83 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  40.83 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  40.83 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  38.26 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  40.83 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  37.14 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  43.56 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  40.83 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  36.79 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  40.37 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  40.37 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  38.97 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  38.24 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  40.83 
 
 		 224 aa  148  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  38.03 
 
 		 240 aa  148  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  37.18 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  34.55 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  37.79 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  44.55 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  37.25 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  36.94 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  37.26 
 
 		 244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  37.85 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  35.75 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  37.61 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  37.44 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  39.01 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  38.12 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  35.02 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  36.79 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>