More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2922 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  60 
 
 		 219 aa  255  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  56.56 
 
 		 219 aa  252  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  57.82 
 
 		 220 aa  251  7e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  56.36 
 
 		 220 aa  250  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  55.35 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  52.04 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  50 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  40.34 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  40.87 
 
 		 230 aa  175  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  45.25 
 
 		 219 aa  174  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  46.61 
 
 		 219 aa  171  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  42.61 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  41.56 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  41.3 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  40.69 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  41.78 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  43.13 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  39.5 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  43 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  40.95 
 
 		 229 aa  157  9e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  40.18 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  40.62 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  42.15 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  40.18 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  39.04 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  44.02 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  39.39 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  40.17 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  37.82 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  40.95 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  40.67 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  39.48 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  39.25 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  39.71 
 
 		 238 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  40.19 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  38.76 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  40.87 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  36.04 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  39.23 
 
 		 238 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  37.34 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  39.53 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  35.96 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  37.13 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  39.62 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  39.52 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  40.89 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  38.83 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  39.15 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  37.18 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  37.38 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  37.99 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  40.87 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  36.09 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03298  alanine racemase domain protein  37.93 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  39.23 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  39.34 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  37.56 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  37.38 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  39.17 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  36.27 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  34.47 
 
 		 237 aa  138  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  40.38 
 
 		 224 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  37.16 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  33.77 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.54 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  36.36 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  34.48 
 
 		 227 aa  136  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  38.1 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  40.97 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  39.15 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  37.2 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  36.76 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09440  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  37.56 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000968769  normal  0.0803306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  37.26 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  36.48 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  37.22 
 
 		 219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  36.45 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  36.67 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  36.67 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  36.67 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  37.79 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  36.67 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  36.67 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  38.46 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  36.67 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  36.67 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  36.49 
 
 		 233 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  36.67 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  36.67 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  35.51 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  35.98 
 
 		 276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  37.79 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  38.16 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  34.96 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  37.67 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  36.49 
 
 		 237 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  35.06 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  36.97 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  37.67 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>