More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4903 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  467  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  66.06 
 
 
222 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  61.09 
 
 
222 aa  292  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  61.88 
 
 
224 aa  285  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  61.43 
 
 
224 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  61.47 
 
 
219 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  58.56 
 
 
228 aa  261  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  52.53 
 
 
221 aa  223  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  39.82 
 
 
213 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  40.95 
 
 
212 aa  164  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  45.16 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  39.37 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  41.36 
 
 
244 aa  161  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  44.7 
 
 
230 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  43.84 
 
 
213 aa  157  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  38.71 
 
 
219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  40 
 
 
231 aa  154  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  41.4 
 
 
240 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  40 
 
 
231 aa  153  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  39.17 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  40.72 
 
 
220 aa  152  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  38.7 
 
 
234 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  39.05 
 
 
211 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  40.58 
 
 
229 aa  151  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  38.7 
 
 
230 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  40.98 
 
 
233 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  38.57 
 
 
211 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  40.98 
 
 
241 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  39.9 
 
 
237 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  42.92 
 
 
227 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  41.55 
 
 
219 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  41.38 
 
 
228 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  42.57 
 
 
235 aa  148  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  39.42 
 
 
239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  37.95 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21481  TIM-barrel fold family protein  40.18 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  37.55 
 
 
226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  35.84 
 
 
233 aa  145  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  40.98 
 
 
228 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  40.49 
 
 
228 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  41.06 
 
 
239 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  40.78 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  40.91 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  40.49 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  41.95 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  40.58 
 
 
232 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  36.8 
 
 
235 aa  145  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  38.28 
 
 
238 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  40.49 
 
 
228 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 
228 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  37.39 
 
 
231 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  38.28 
 
 
238 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  38.92 
 
 
231 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  40.78 
 
 
276 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  40.2 
 
 
232 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  37.95 
 
 
232 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  39.05 
 
 
232 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  40.29 
 
 
232 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  37.25 
 
 
235 aa  142  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  37.61 
 
 
230 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  37.8 
 
 
238 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  39.9 
 
 
237 aa  142  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  38.05 
 
 
236 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  37.67 
 
 
244 aa  141  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04451  TIM-barrel fold family protein  38.58 
 
 
190 aa  141  7e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.344267  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  39.56 
 
 
232 aa  141  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  38.36 
 
 
244 aa  141  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  38.03 
 
 
233 aa  141  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  40.29 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  38.73 
 
 
199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  39.51 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  40 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  39.27 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  40.69 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  37.93 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  36.32 
 
 
230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  36.24 
 
 
228 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  35.32 
 
 
227 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  41.06 
 
 
231 aa  138  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  37.85 
 
 
237 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  34.68 
 
 
253 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03298  alanine racemase domain protein  40 
 
 
202 aa  138  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  36.05 
 
 
233 aa  137  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  36.84 
 
 
237 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  34.2 
 
 
236 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2418  hypothetical protein  39.71 
 
 
246 aa  136  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  37.05 
 
 
257 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  37.84 
 
 
271 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  34.63 
 
 
234 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  34.86 
 
 
223 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  35.96 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  38.26 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2061  TIM-barrel fold family protein  36.45 
 
 
225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  38.35 
 
 
229 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  40.97 
 
 
229 aa  135  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  35.53 
 
 
232 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  35.53 
 
 
242 aa  135  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  37.84 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  38.03 
 
 
241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 
202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>