More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_04451 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_04451  TIM-barrel fold family protein  100 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.344267  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  93.12 
 
 		 211 aa  357  7e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  87.89 
 
 		 211 aa  341  4e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  70.53 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21481  TIM-barrel fold family protein  52.63 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  51.85 
 
 		 199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  52.38 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  52.38 
 
 		 213 aa  207  7e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  48.68 
 
 		 220 aa  206  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  51.85 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  42.54 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  42.35 
 
 		 224 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  41.84 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  40.59 
 
 		 228 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  44.13 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  38.78 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  36.36 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  37.88 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  38.58 
 
 		 226 aa  141  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  40.62 
 
 		 228 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  41.67 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  37.88 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  40.31 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  33.68 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  36.27 
 
 		 229 aa  125  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  38.66 
 
 		 231 aa  125  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  39.58 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  40.1 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  35.9 
 
 		 236 aa  124  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  39.58 
 
 		 228 aa  124  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  39.38 
 
 		 228 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  37.06 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  36.92 
 
 		 235 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  36.36 
 
 		 212 aa  121  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  35.64 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  37.24 
 
 		 230 aa  121  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  39.06 
 
 		 228 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  40.31 
 
 		 228 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  42.78 
 
 		 231 aa  120  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  41.33 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  36.92 
 
 		 241 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  32.31 
 
 		 246 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  37.57 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  38.54 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  38.19 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  33.86 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  34.18 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  36.65 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  35.16 
 
 		 255 aa  118  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  39.04 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  36.32 
 
 		 229 aa  118  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  35.86 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  33.5 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  34.18 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  37.36 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  35.15 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  38.12 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  34.18 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  35.35 
 
 		 268 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  34.18 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  40.91 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  35.79 
 
 		 226 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  37.36 
 
 		 237 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  37.65 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  35.57 
 
 		 235 aa  115  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2418  hypothetical protein  37.11 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  34.85 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  38.31 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  35.07 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  33.16 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  36.87 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  36.31 
 
 		 239 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  36.6 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  36.41 
 
 		 229 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  37.06 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  35.79 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  39.55 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  35.39 
 
 		 232 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  35.39 
 
 		 242 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  36.04 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  37.36 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  36.13 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  36.81 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  33.67 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  34.18 
 
 		 237 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  33.86 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  32.98 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  35.71 
 
 		 232 aa  111  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  33.68 
 
 		 227 aa  111  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  38.5 
 
 		 233 aa  111  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2411  hypothetical protein  33.67 
 
 		 245 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0328  hypothetical protein  33.67 
 
 		 245 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1189  hypothetical protein  33.67 
 
 		 245 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2598  hypothetical protein  33.67 
 
 		 245 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.734317  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  36.5 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  33 
 
 		 249 aa  110  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  33.99 
 
 		 241 aa  110  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  32.98 
 
 		 250 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>