More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2060 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  441  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  53.85 
 
 		 222 aa  249  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  54.09 
 
 		 222 aa  247  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  53 
 
 		 224 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  53 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  52.53 
 
 		 226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  55.86 
 
 		 228 aa  237  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  52.78 
 
 		 219 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  49.54 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  43.33 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  43.26 
 
 		 213 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  50.25 
 
 		 199 aa  192  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  43.26 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21481  TIM-barrel fold family protein  47.25 
 
 		 225 aa  187  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  39.71 
 
 		 211 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  39.52 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  47.14 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  46.27 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  48.78 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  44.1 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  47.8 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  45.58 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  47.8 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  43.23 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  48.02 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  43.22 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  45.34 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  42.6 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04451  TIM-barrel fold family protein  40.61 
 
 		 190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.344267  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  43.23 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  41.26 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  45.87 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  40.36 
 
 		 227 aa  161  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  43.46 
 
 		 241 aa  161  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  44.39 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  43.78 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  44.28 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  46.15 
 
 		 237 aa  158  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  43.06 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  46.57 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  40.37 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  39.13 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  43.72 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  40.87 
 
 		 234 aa  151  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  38.2 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  44.44 
 
 		 232 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  41.99 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  35.29 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  36.45 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  41.26 
 
 		 233 aa  148  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  43.51 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  39.8 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  44.12 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  45.06 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  42.25 
 
 		 229 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  40.97 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  40.87 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  35.78 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  40.19 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  38.05 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  46.63 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  41.87 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  44.35 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  36.8 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  35.96 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  38.1 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  35.29 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  45.45 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  38.18 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  39.02 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  38.99 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  34.1 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  33.82 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  44.81 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2061  TIM-barrel fold family protein  34.5 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  44.29 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  36.99 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  42.11 
 
 		 272 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  43.95 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  41.04 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  42.42 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  42.42 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 		 247 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  34.1 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  36.96 
 
 		 238 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  38.77 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  42.17 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  37.28 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  41.3 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  38.03 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  42.62 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  36.41 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  43.14 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  33.04 
 
 		 253 aa  141  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  41.99 
 
 		 232 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  38.03 
 
 		 232 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  41.3 
 
 		 250 aa  141  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  42.03 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  41.35 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>