More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_21481 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_21481  TIM-barrel fold family protein  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  67.34 
 
 		 199 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  63.81 
 
 		 220 aa  261  6.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  57.82 
 
 		 213 aa  252  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  63.59 
 
 		 213 aa  251  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  57.82 
 
 		 213 aa  251  7e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  51.21 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  49.52 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  54.08 
 
 		 212 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04451  TIM-barrel fold family protein  52.63 
 
 		 190 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.344267  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  47.25 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  44.95 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  44.95 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  46.92 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  45.16 
 
 		 219 aa  167  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  42.47 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  41.1 
 
 		 222 aa  151  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  40.76 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  45.23 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  40.18 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  41.71 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  42.44 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  43.75 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  42.71 
 
 		 212 aa  141  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  43.27 
 
 		 230 aa  141  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  36.95 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  39.81 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  43 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  38.07 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  38.86 
 
 		 227 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  40.28 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  39.23 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  42.93 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  39.34 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  38.79 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  39.11 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  40.8 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  39.71 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  37.8 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  37.86 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  33.98 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  41.09 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  40.1 
 
 		 229 aa  131  9e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  38.28 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  40.69 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  40.8 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  34.36 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  39.71 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  42.08 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  43.2 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  39.11 
 
 		 272 aa  128  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  37.25 
 
 		 231 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  38.94 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  39.3 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  38.94 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  39.09 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  37.95 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  39.53 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  38.83 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  34.74 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  37.13 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  39.11 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  38.81 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  40.74 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  32.46 
 
 		 233 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  38.31 
 
 		 239 aa  124  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  38.92 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  36.24 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  29.91 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  39.81 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  37.75 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  37.44 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  38.65 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  36.36 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  32.42 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  39.02 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  37.85 
 
 		 238 aa  121  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  41.67 
 
 		 268 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  34.13 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  41.33 
 
 		 228 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  37.8 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  41.18 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  35.61 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  39.9 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  34.65 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  33.49 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  36.63 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  34.95 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  40.28 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  31.25 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  38.21 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  34.26 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  36.89 
 
 		 229 aa  118  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.25 
 
 		 244 aa  118  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2061  TIM-barrel fold family protein  34.5 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  38.73 
 
 		 239 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  38.05 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  38.73 
 
 		 239 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  34.95 
 
 		 231 aa  118  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  35.29 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>