More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0415 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 225 aa  460  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  49.77 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  48.86 
 
 		 226 aa  228  8e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  47.83 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  48.57 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  51.24 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  47.6 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  49.05 
 
 		 219 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  46.4 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  48.31 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  48.1 
 
 		 219 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  47.57 
 
 		 227 aa  214  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  47.06 
 
 		 230 aa  214  8e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  46.38 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  46.6 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  47.03 
 
 		 230 aa  213  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  48.57 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  45.67 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  46.83 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  46.63 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  52.04 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  45.19 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  46.76 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  45.19 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  46.63 
 
 		 228 aa  208  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  46.38 
 
 		 250 aa  208  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  43.66 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  47.96 
 
 		 221 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  47.09 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  47.17 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  47.2 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  40.09 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  47.96 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  43.78 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  43.78 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  48.19 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  45.13 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  44.13 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  44.29 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  45.24 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  47.15 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  47.92 
 
 		 191 aa  179  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  42.15 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  44.71 
 
 		 219 aa  174  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  38.7 
 
 		 233 aa  148  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  42.06 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  37.83 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  37.78 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  37.27 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  39.46 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  35.62 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  37.55 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  37.55 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  38.43 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  36.68 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  39.17 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  38.39 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  38.71 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  37.83 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  38.86 
 
 		 213 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  36.84 
 
 		 228 aa  134  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  40.1 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  39.59 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  43.08 
 
 		 213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  36.84 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  35.1 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  38.71 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  33.77 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  37.5 
 
 		 236 aa  132  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  37.12 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  37.12 
 
 		 238 aa  132  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  36.36 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  36.52 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  42.56 
 
 		 213 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  36.27 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  33.76 
 
 		 241 aa  131  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  40.18 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  35.29 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  39.81 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  34.17 
 
 		 248 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  36.27 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  34.66 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  38.29 
 
 		 275 aa  129  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  35.59 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  35.84 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  34.2 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  39.19 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  37.34 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  34.21 
 
 		 232 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  36.07 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  37.17 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  35.22 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  35.47 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  35.9 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  37.28 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  38.76 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  36.12 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  38.76 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  35.09 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  37.63 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>