More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2503 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  97.31 
 
 
223 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  97.76 
 
 
223 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  82.32 
 
 
213 aa  328  4e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  49.78 
 
 
228 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  45.97 
 
 
224 aa  190  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  46.72 
 
 
230 aa  188  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  50.25 
 
 
231 aa  188  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  47.81 
 
 
229 aa  187  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  47.64 
 
 
272 aa  187  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  49.27 
 
 
237 aa  185  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  46.09 
 
 
230 aa  185  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  44.98 
 
 
228 aa  185  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  53.03 
 
 
230 aa  185  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  48.23 
 
 
234 aa  184  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  52.76 
 
 
228 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  51.2 
 
 
228 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  43.78 
 
 
235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  47.66 
 
 
236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  52.26 
 
 
228 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  45.85 
 
 
229 aa  181  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  52.26 
 
 
228 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  45.85 
 
 
231 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  47.32 
 
 
231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  48.2 
 
 
228 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  51.76 
 
 
228 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  50.25 
 
 
235 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  50.49 
 
 
241 aa  178  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  55.88 
 
 
239 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  55.88 
 
 
239 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  52 
 
 
229 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  51.27 
 
 
228 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  46.52 
 
 
228 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  44.49 
 
 
227 aa  176  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  44.93 
 
 
229 aa  176  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  48.29 
 
 
229 aa  175  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  45.95 
 
 
244 aa  175  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  55.39 
 
 
232 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  46 
 
 
230 aa  174  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  44.78 
 
 
229 aa  174  8e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  45.21 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  49.3 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  46.72 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  48.71 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  43 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  42.29 
 
 
226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  55.39 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  53.92 
 
 
232 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  47.69 
 
 
247 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  48.31 
 
 
229 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  54.41 
 
 
268 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  50.75 
 
 
227 aa  171  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  54.11 
 
 
238 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  50.74 
 
 
229 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  47.18 
 
 
247 aa  170  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  48.48 
 
 
217 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  51.47 
 
 
232 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  48.74 
 
 
227 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  52.97 
 
 
232 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  49.75 
 
 
234 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  52.11 
 
 
238 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  54.59 
 
 
238 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  43.84 
 
 
234 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  46.73 
 
 
244 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  45.27 
 
 
226 aa  166  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  41.4 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  46.35 
 
 
237 aa  166  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  43.91 
 
 
237 aa  165  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  39.45 
 
 
219 aa  165  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  46.48 
 
 
232 aa  164  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  47.09 
 
 
235 aa  164  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  50.49 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  40.69 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  47.92 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  41.85 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  43.35 
 
 
231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  42.36 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  51.24 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  50.75 
 
 
232 aa  161  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  43.64 
 
 
220 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  38.12 
 
 
253 aa  161  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  48.06 
 
 
270 aa  161  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  41.5 
 
 
228 aa  160  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  44.49 
 
 
229 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  52.48 
 
 
229 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2655  alanine racemase domain-containing protein  54.9 
 
 
235 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  41.28 
 
 
230 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  43.81 
 
 
229 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  43.81 
 
 
229 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  41.41 
 
 
233 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  39.6 
 
 
235 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  42.99 
 
 
224 aa  159  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  47.42 
 
 
228 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  48.04 
 
 
271 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  45.88 
 
 
225 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  36.7 
 
 
219 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  46.67 
 
 
250 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  48.28 
 
 
221 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  42.73 
 
 
233 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  40.91 
 
 
202 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>