More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0153 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 235 aa  474  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  59.29 
 
 		 228 aa  272  3e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  54.09 
 
 		 231 aa  249  4e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  53.81 
 
 		 229 aa  230  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  53.81 
 
 		 229 aa  230  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  46.02 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  46.46 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  48.68 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  44.25 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  47.26 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  45.81 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  42.04 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  49.12 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  39.82 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  43.81 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  47.56 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  48.89 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  43.36 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  43.75 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  46.15 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  45.29 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  43.56 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  39.57 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  39.82 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  43.38 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  45.29 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  43.78 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  46.9 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  42.57 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  44.06 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  43.36 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  43.5 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  41.58 
 
 		 213 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09440  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  37.89 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000968769  normal  0.0803306 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  38.67 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  44.88 
 
 		 219 aa  175  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  39.47 
 
 		 234 aa  174  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  38.16 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  38.57 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  42.5 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  42.79 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  42.31 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  41.78 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  40.43 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  41.3 
 
 		 229 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  37.73 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  44.55 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  42.99 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  37.28 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  39.74 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  44.12 
 
 		 219 aa  169  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  46.08 
 
 		 202 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  39.56 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  38.86 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  44.61 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  37.89 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  43.1 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  42.38 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  39.46 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  42.66 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  36.44 
 
 		 259 aa  164  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  41.44 
 
 		 234 aa  164  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  40.38 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  40.51 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  41.85 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  37.44 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  41.75 
 
 		 219 aa  162  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08910  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  37.44 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0151637  hitchhiker  0.0000000329342 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  44.39 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  37.77 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  39.53 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  40.26 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  43 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  39.53 
 
 		 232 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  36.16 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  38.6 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  38.46 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  37.07 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  36.84 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  35.74 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  43.69 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  35.34 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  38.89 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  38.26 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  37.55 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  34.6 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  39.39 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  42.21 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  39.29 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  36.28 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  38.16 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  37.07 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  35.75 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  38.37 
 
 		 248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  41.3 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  37.8 
 
 		 272 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  35.81 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>