More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2011 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 220 aa  454  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  65.44 
 
 		 219 aa  300  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  60.09 
 
 		 219 aa  285  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  62.07 
 
 		 220 aa  276  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  54.59 
 
 		 219 aa  251  6e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  56.36 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  57.08 
 
 		 225 aa  231  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  49.78 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  45.61 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  45.18 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  46.49 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  42.55 
 
 		 244 aa  189  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  42.91 
 
 		 253 aa  189  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  45.18 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  46.57 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  44.5 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  44.98 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  44.95 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  43.86 
 
 		 231 aa  177  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  46.53 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  46.08 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  41.71 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  42.27 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  43.17 
 
 		 237 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  44.95 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  43.4 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  45.23 
 
 		 202 aa  168  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  44.74 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  41.3 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  40.27 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  40.91 
 
 		 280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  40.34 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  43.56 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  43.64 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  42.01 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  44.5 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  44.39 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  41.07 
 
 		 233 aa  159  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  42.5 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  40.35 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  42.73 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  41.95 
 
 		 275 aa  155  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  39.32 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  38.3 
 
 		 229 aa  155  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  38.07 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  40.77 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  41.75 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  38.3 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  42.24 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  38.53 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  39.41 
 
 		 283 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  41.2 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  41.15 
 
 		 276 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  40.77 
 
 		 238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  40.34 
 
 		 232 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  40.77 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  39.63 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  40 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  42.73 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  41.09 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  40.77 
 
 		 238 aa  148  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  41.29 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  41.55 
 
 		 262 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  37.44 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  41.46 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  38.6 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  40.87 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  39.9 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  39.11 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  37.34 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  39.06 
 
 		 235 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  36.82 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  41.79 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  36.61 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  41.79 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  40.17 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  35.93 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  36.21 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  39.21 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  39.56 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  37.16 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  37.5 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  38.61 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  40.34 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  40.19 
 
 		 241 aa  141  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  39.9 
 
 		 227 aa  141  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  40.19 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  37.34 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  39.74 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_002936  DET0758  hypothetical protein  35.02 
 
 		 220 aa  141  9e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28716  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  40.69 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  38.63 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  39.74 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  36.56 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  37.72 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  39.61 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  35.78 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  36.86 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>