More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0753 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  457  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1272  alanine racemase domain-containing protein  74.55 
 
 		 222 aa  347  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000279227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1247  alanine racemase domain-containing protein  74.55 
 
 		 222 aa  347  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000447038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  55.61 
 
 		 226 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  55.41 
 
 		 224 aa  254  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  54.5 
 
 		 224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  54.5 
 
 		 224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  54.05 
 
 		 224 aa  248  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  54.05 
 
 		 224 aa  248  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  54.05 
 
 		 224 aa  248  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  54.05 
 
 		 224 aa  248  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  54.05 
 
 		 224 aa  248  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  53.15 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  53.15 
 
 		 224 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  51.35 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  53.15 
 
 		 224 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2061  TIM-barrel fold family protein  51.13 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  49.11 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0480  ylmE protein, putative  46.61 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  42.22 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  39.38 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  36.84 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  38.94 
 
 		 230 aa  165  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  38.22 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  42.42 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  40.27 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  40.09 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  41.07 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  43.56 
 
 		 202 aa  158  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  40.18 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  36.65 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  42.42 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  38.5 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  35.4 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  40.1 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  42.93 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  38.27 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  35.4 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  37.05 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  40.45 
 
 		 223 aa  145  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  36.44 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  36.44 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  38.01 
 
 		 262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  39.39 
 
 		 213 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  37.67 
 
 		 224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  36.28 
 
 		 228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  39.7 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  38.94 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  43.28 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  38.05 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  37.05 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  36.84 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  38.19 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  40.4 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  36.44 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  36.32 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  37.56 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  37.67 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  38.63 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  35.84 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  34.22 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  36.52 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  34.96 
 
 		 270 aa  138  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  36.96 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  34.96 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  35.4 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  36.73 
 
 		 222 aa  137  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  38.19 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  34.96 
 
 		 237 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  32.89 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  37.55 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  38.84 
 
 		 244 aa  135  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  33.48 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  34.51 
 
 		 280 aa  135  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  34.39 
 
 		 276 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  35.53 
 
 		 261 aa  134  8e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  34.84 
 
 		 247 aa  134  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  39.5 
 
 		 229 aa  134  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  38.36 
 
 		 229 aa  134  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  34.65 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  33.78 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  36.65 
 
 		 271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  36.56 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  37.84 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  34.96 
 
 		 275 aa  132  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  36.41 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  37.06 
 
 		 235 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  31.58 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  36.68 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  36.59 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  35.84 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  37.44 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  38.61 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  34.35 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  36.44 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  34.53 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  36.96 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  36 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  34.07 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>