More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1026 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  53.81 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  49.78 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  51.85 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  44.84 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  43.56 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  46.22 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  43.5 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  44.89 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  43.5 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  43.11 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  44.2 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  48.67 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  44.44 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  45.81 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  44.84 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  44.89 
 
 		 240 aa  178  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  44.64 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  42.41 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  44 
 
 		 231 aa  175  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  41.78 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  42.11 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  42.41 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  41.52 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  42.41 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  44.29 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  41.07 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  45.23 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  42.54 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  40.89 
 
 		 231 aa  168  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  41.52 
 
 		 224 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  41.07 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  41.07 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  41.07 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  41.07 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  41.07 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  45.58 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  41.41 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 233 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  42.73 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  37.95 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  40.62 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  38.37 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  41.33 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09440  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.7 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000968769  normal  0.0803306 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  41.78 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  43.81 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 223 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2084  alanine racemase domain protein  40.35 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000045543  hitchhiker  0.0000000000000968323 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  40.89 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  37.84 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  43.59 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  41.15 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  42.99 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  40.25 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  40.26 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  42.08 
 
 		 213 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0480  ylmE protein, putative  34.51 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  40.3 
 
 		 219 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  37.28 
 
 		 242 aa  151  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 244 aa  151  8e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  40.17 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3523  alanine racemase domain protein  39.73 
 
 		 222 aa  151  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.758278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  38.76 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08910  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.04 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0151637  hitchhiker  0.0000000329342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  39.45 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  42.44 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  38.43 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  42.22 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  41.96 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  37.61 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  41.89 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  39.73 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  40.89 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  37.56 
 
 		 276 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  42.38 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  36.44 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  36.77 
 
 		 275 aa  145  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  36.89 
 
 		 216 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  36.77 
 
 		 257 aa  144  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  36.44 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  37.73 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  36.51 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  41.79 
 
 		 220 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  38.64 
 
 		 271 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  37.12 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  38.64 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  37.28 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  36.44 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1272  alanine racemase domain-containing protein  36.44 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000279227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1247  alanine racemase domain-containing protein  36.44 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000447038  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  38.12 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  36.16 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  37.56 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  38.57 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  41.04 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  37.13 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  36.36 
 
 		 271 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>