More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08910 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08910  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0151637  hitchhiker  0.0000000329342 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09440  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  51.09 
 
 		 230 aa  228  8e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000968769  normal  0.0803306 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2084  alanine racemase domain protein  55.67 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000045543  hitchhiker  0.0000000000000968323 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  37.44 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  38.6 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  39.04 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  39.04 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  39.48 
 
 		 244 aa  148  6e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  35.4 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  37.17 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  36.36 
 
 		 226 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  40.26 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  42.51 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  39.47 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  37 
 
 		 228 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  37.16 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  38.53 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  39.82 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  34.8 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  34.35 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  34.96 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  33.92 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  38.97 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  36.22 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  35.81 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  36 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  32.74 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  35.22 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  35.93 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  36.95 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  37.39 
 
 		 229 aa  128  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  32.91 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  39.37 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  38.81 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  36.21 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  35.37 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  33.63 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  35.53 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  33.63 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  33.63 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  33.63 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  33.63 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  33.63 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  33.63 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  38.92 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  35.09 
 
 		 223 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  36.64 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  39.41 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  37.93 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  32.46 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  36.53 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  37.73 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  37.05 
 
 		 272 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  38.16 
 
 		 228 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  33.91 
 
 		 223 aa  121  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  36.06 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  36.2 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  32.74 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  37.55 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  35.84 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  33.18 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  33.18 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  33.04 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  37.31 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  33.62 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  34.12 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  34.88 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  37 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  35.37 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  35.14 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  33.65 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  36.45 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  34.78 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  33.33 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  37.04 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  34.65 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  35 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  36.82 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  31.74 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  33.88 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  36.32 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1426  hypothetical protein  36 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955948  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0268  hypothetical protein  31 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  36.32 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  33.63 
 
 		 237 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  33.78 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  35.32 
 
 		 237 aa  111  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  36.02 
 
 		 235 aa  111  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  35.45 
 
 		 250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  35.15 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  29.07 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  37 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0294  hypothetical protein  31.74 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  34.73 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  31.78 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2061  TIM-barrel fold family protein  32.75 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  33.04 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  35 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1247  alanine racemase domain-containing protein  34 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000447038  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1272  alanine racemase domain-containing protein  34 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000279227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>