More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1426 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1426  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955948  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  48.87 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  45.7 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  37.68 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  35.75 
 
 		 235 aa  134  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  34.78 
 
 		 235 aa  132  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  37.5 
 
 		 234 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  36.28 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  37.05 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  35.14 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  35.65 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  34.93 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  36.99 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0159  alanine racemase domain protein  32.77 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00156899  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  31.05 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09440  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  35.94 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000968769  normal  0.0803306 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08910  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  36 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0151637  hitchhiker  0.0000000329342 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  41.18 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  37.44 
 
 		 231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  39.82 
 
 		 247 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  43.61 
 
 		 247 aa  118  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  35.53 
 
 		 230 aa  118  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  37.44 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  38.63 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  38.64 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  37.61 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  41.63 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  40.09 
 
 		 240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  41.48 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  38.91 
 
 		 247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  39.82 
 
 		 271 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  41.03 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  39.82 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  36.57 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  39.73 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  31.88 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  38.91 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  39.47 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  38.98 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  38.91 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  37.28 
 
 		 229 aa  111  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  36.04 
 
 		 218 aa  111  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  38.46 
 
 		 234 aa  111  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  35.34 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  40.72 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  39.27 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  38.6 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  41.82 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  36.52 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  39.82 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  32.37 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  38.99 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  40.19 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  36.11 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  38.6 
 
 		 259 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  31.58 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2084  alanine racemase domain protein  39.89 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000045543  hitchhiker  0.0000000000000968323 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  38.56 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  37.32 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  36.99 
 
 		 235 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  38.07 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  30.73 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  39.21 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  38.74 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  39.32 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  37.9 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  38.6 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  31.86 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  37.39 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  39.45 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  39.9 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  34.48 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  38.33 
 
 		 219 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  39.74 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  37.5 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  38.14 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  36.75 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  40.38 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  38.32 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  32.51 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  39.73 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  39.04 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  36.96 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  34.09 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21481  TIM-barrel fold family protein  37.75 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  41.71 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  41.71 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  39.91 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  38.83 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  36.48 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  36.02 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  33.65 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  38.01 
 
 		 271 aa  101  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  38.79 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  40.29 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  34.06 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  34.91 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  35.12 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  34.06 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  38.22 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>