More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0159 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0159  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 231 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00156899  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  42.65 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  39.37 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  41.33 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  36.4 
 
 		 223 aa  138  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  37.5 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  34.91 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  35.68 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  34.8 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1235  hypothetical protein  37.16 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  33.77 
 
 		 236 aa  131  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  37.39 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  35.96 
 
 		 275 aa  129  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  38.92 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  31.58 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  38.63 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  36.84 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  35.84 
 
 		 231 aa  128  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  33.48 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  31.11 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  34.52 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  33.04 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  38.31 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  38.31 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  34.27 
 
 		 253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  36.61 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  40.45 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  39.32 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  37.75 
 
 		 202 aa  125  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  35.15 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  33.83 
 
 		 233 aa  124  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  34.65 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  32 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  32.16 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  34.31 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  33.49 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1062  alanine racemase domain protein  32.16 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  32.34 
 
 		 235 aa  122  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  34.63 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  31.86 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09440  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  34.48 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000968769  normal  0.0803306 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  35.96 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  33.17 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  37.93 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  35.5 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  28.95 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  35.27 
 
 		 228 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  34 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  34.83 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  30.83 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  34.48 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  34.16 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  31.28 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  36.63 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  36.99 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  34.67 
 
 		 228 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  32.34 
 
 		 233 aa  118  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1134  hypothetical protein  38.1 
 
 		 211 aa  118  7e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  34.5 
 
 		 239 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  34.78 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  35 
 
 		 232 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  31.42 
 
 		 233 aa  118  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  37.21 
 
 		 230 aa  118  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  35.15 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  32.08 
 
 		 242 aa  118  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  34 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  31.86 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  31.34 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0125  hypothetical protein  37.44 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  29.54 
 
 		 244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  33.99 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  33.03 
 
 		 226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  33 
 
 		 227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  31.14 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  29.78 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  36.76 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  30.22 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  31.19 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  32.75 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  37.13 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3040  alanine racemase domain-containing protein  32.75 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  30.5 
 
 		 229 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  32.84 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  33.82 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  30.53 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  29.82 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  27.95 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  31.02 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  29.78 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  33.99 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08000  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  34.27 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0412796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  31.63 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  30.05 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1426  hypothetical protein  32.77 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955948  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  28.89 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  33.99 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>