More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1062 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1062  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 225 aa  463  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1235  hypothetical protein  55.8 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0608  hypothetical protein  52.83 
 
 		 215 aa  227  9e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1134  hypothetical protein  54.59 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0125  hypothetical protein  54.59 
 
 		 212 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0859  hypothetical protein  53.06 
 
 		 205 aa  209  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0742  hypothetical protein  51.52 
 
 		 210 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.14664  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1287  hypothetical protein  51.01 
 
 		 210 aa  198  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.472331  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0819  hypothetical protein  51.52 
 
 		 210 aa  198  7e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0749  hypothetical protein  47.96 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0140325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  38.69 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  35.65 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  36.77 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  41 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  37.33 
 
 		 275 aa  136  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  36.32 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  36.32 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  38.67 
 
 		 233 aa  134  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  34.09 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  38.92 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  36.76 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  35.93 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  36.27 
 
 		 238 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  35.06 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  36.27 
 
 		 238 aa  128  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  36.14 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  41.5 
 
 		 219 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  33.92 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  37.38 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  36.7 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  36.63 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  35.03 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  34.63 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  33.16 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  36.14 
 
 		 239 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  35 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  34.5 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  35.03 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  34.85 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  34.5 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  37 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  36.14 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  31.17 
 
 		 271 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  34.48 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  35.47 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  32.56 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  38.38 
 
 		 235 aa  122  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  36.14 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  31.98 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  35.29 
 
 		 232 aa  121  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0159  alanine racemase domain protein  32.16 
 
 		 231 aa  121  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00156899  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  35.29 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  37.88 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  34.16 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_002936  DET0758  hypothetical protein  34.33 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28716  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  33.48 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  36.22 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  35.15 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  34 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  31.92 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  34.31 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  34.53 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  30.28 
 
 		 276 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  34 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  34.31 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  35.5 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  32.88 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  34.5 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  36.73 
 
 		 227 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  34.4 
 
 		 219 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  34.85 
 
 		 237 aa  118  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  32.29 
 
 		 244 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  37.24 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  33.66 
 
 		 220 aa  118  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  35.32 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0685  alanine racemase domain-containing protein  34.5 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.268017  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  34.33 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  35 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  35.32 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  35.64 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  33.5 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  34.65 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  32.66 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  36 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2190  hypothetical cytosolic protein  37.06 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.724398  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2216  hypothetical protein  37.06 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000309161  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  35.35 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  35.12 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  34.65 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  32.5 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  35.53 
 
 		 202 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  33.77 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3702  alanine racemase domain protein  34.52 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  34.65 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  36 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  34.1 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  33.03 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  29.82 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  37.25 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>