More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0819 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0819  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  424  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0742  hypothetical protein  99.52 
 
 
210 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.14664  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1287  hypothetical protein  96.67 
 
 
210 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.472331  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0749  hypothetical protein  74.16 
 
 
205 aa  305  2.0000000000000002e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0140325  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0608  hypothetical protein  63.27 
 
 
215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0859  hypothetical protein  59.42 
 
 
205 aa  252  3e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1134  hypothetical protein  53.43 
 
 
211 aa  222  3e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0125  hypothetical protein  54.41 
 
 
212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1062  alanine racemase domain protein  51.52 
 
 
225 aa  198  6e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1235  hypothetical protein  50.76 
 
 
224 aa  186  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  36.41 
 
 
235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  38.19 
 
 
229 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  38.42 
 
 
224 aa  123  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01490  conserved hypothetical protein  39.45 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  34.78 
 
 
234 aa  118  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  33.98 
 
 
247 aa  117  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  35.53 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  35.53 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  37.07 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  35.82 
 
 
238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  35.44 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  34.29 
 
 
229 aa  115  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  36.76 
 
 
231 aa  114  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  33.98 
 
 
225 aa  114  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  35.58 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  35.61 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  35.78 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  36.95 
 
 
219 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  37.07 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40339  predicted protein  34.27 
 
 
237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  30.39 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  33 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  34 
 
 
230 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  35.12 
 
 
239 aa  111  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  32.5 
 
 
224 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  33.5 
 
 
227 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  33.66 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  32.68 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  32 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  36.1 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  32.34 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  32.34 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  35.78 
 
 
229 aa  109  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  35.47 
 
 
219 aa  109  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  32.84 
 
 
224 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  33.17 
 
 
228 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  38.65 
 
 
227 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  34.8 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  32.35 
 
 
224 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  32.35 
 
 
224 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  32.35 
 
 
224 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  33.5 
 
 
229 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  32.35 
 
 
224 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  32.35 
 
 
224 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  29.33 
 
 
271 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  35.61 
 
 
232 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  30.1 
 
 
276 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  34.83 
 
 
237 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  32.04 
 
 
222 aa  106  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  32.2 
 
 
219 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  36.06 
 
 
227 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  35.32 
 
 
241 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  33.83 
 
 
231 aa  106  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48387  predicted protein  38.57 
 
 
250 aa  105  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.181338 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  33.97 
 
 
235 aa  106  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  32.02 
 
 
257 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  36.95 
 
 
219 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  31.68 
 
 
219 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  33.49 
 
 
220 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_5512  predicted protein  33.63 
 
 
250 aa  105  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.050444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  33.84 
 
 
202 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  30.39 
 
 
271 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  29.72 
 
 
224 aa  105  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  31.68 
 
 
233 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  32.51 
 
 
236 aa  105  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0452  alanine racemase domain protein  32.3 
 
 
258 aa  105  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  32.54 
 
 
220 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  31.92 
 
 
229 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  34.67 
 
 
228 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  30.05 
 
 
262 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07017  alanine racemase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04300)  35.4 
 
 
272 aa  103  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361048  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  35.47 
 
 
233 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  34.63 
 
 
226 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  34.67 
 
 
228 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  31.03 
 
 
226 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  33.49 
 
 
241 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  33.83 
 
 
238 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  35.29 
 
 
237 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0159  alanine racemase domain protein  34.8 
 
 
231 aa  102  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00156899  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  33.17 
 
 
218 aa  102  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  33.5 
 
 
222 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  35.12 
 
 
230 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3040  alanine racemase domain-containing protein  35.71 
 
 
232 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532898  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  36.23 
 
 
275 aa  102  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  34.78 
 
 
234 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0480  ylmE protein, putative  31.68 
 
 
224 aa  101  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  30.15 
 
 
224 aa  101  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  32.16 
 
 
213 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  34.98 
 
 
232 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  29.5 
 
 
213 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>