More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0608 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0608  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0859  hypothetical protein  69.95 
 
 
205 aa  279  3e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1134  hypothetical protein  65.13 
 
 
211 aa  265  2.9999999999999995e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0125  hypothetical protein  63.64 
 
 
212 aa  262  3e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1287  hypothetical protein  63.27 
 
 
210 aa  254  8e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.472331  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0742  hypothetical protein  63.27 
 
 
210 aa  254  9e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.14664  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0819  hypothetical protein  63.27 
 
 
210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0749  hypothetical protein  62.76 
 
 
205 aa  249  3e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0140325  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1062  alanine racemase domain protein  52.83 
 
 
225 aa  227  8e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1235  hypothetical protein  48.84 
 
 
224 aa  206  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  36.94 
 
 
246 aa  137  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  37.39 
 
 
235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  36.04 
 
 
234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  36.97 
 
 
235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  35.78 
 
 
224 aa  124  8.000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  34.65 
 
 
235 aa  122  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  37.22 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  36.82 
 
 
239 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  37.44 
 
 
241 aa  118  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  36.32 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  32.73 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  31.98 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  34.68 
 
 
275 aa  116  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  36.44 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  31.65 
 
 
231 aa  115  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  37.75 
 
 
229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  36.28 
 
 
230 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  35.96 
 
 
236 aa  114  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  34.78 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  33.78 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  35.21 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  34.55 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  34.93 
 
 
241 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  33.18 
 
 
222 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  35.21 
 
 
223 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  32.27 
 
 
271 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  35.71 
 
 
228 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  34.63 
 
 
229 aa  111  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  34.25 
 
 
259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  34.98 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  30.32 
 
 
233 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  33.64 
 
 
269 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  32.46 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  31.58 
 
 
224 aa  109  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  35.43 
 
 
230 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  37.32 
 
 
229 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  35.68 
 
 
235 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  34.25 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  35.14 
 
 
227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  36.36 
 
 
234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  34.93 
 
 
244 aa  108  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0159  alanine racemase domain protein  35.98 
 
 
231 aa  108  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00156899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  32.11 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  36.1 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  33.91 
 
 
222 aa  108  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  31.9 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  35.11 
 
 
236 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  36.27 
 
 
239 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  31.9 
 
 
219 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  34.98 
 
 
230 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  34.53 
 
 
231 aa  106  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  33.5 
 
 
241 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  36.55 
 
 
228 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 
213 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  34.2 
 
 
232 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2061  TIM-barrel fold family protein  32.7 
 
 
225 aa  106  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  33.48 
 
 
234 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  37.8 
 
 
232 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  34.27 
 
 
223 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  31.8 
 
 
229 aa  105  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1178  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 
255 aa  105  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  normal  0.161066 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  36.79 
 
 
244 aa  105  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  36.55 
 
 
228 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  33.19 
 
 
219 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3702  alanine racemase domain protein  37.98 
 
 
237 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  35.64 
 
 
211 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  32.75 
 
 
232 aa  105  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  32.72 
 
 
229 aa  105  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  30 
 
 
262 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  36.61 
 
 
233 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  31.44 
 
 
238 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  34.48 
 
 
237 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  33.64 
 
 
226 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  34.83 
 
 
249 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  34.26 
 
 
229 aa  104  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  35.35 
 
 
228 aa  104  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  33.33 
 
 
255 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  33.48 
 
 
230 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  33.17 
 
 
229 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  34.55 
 
 
221 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  36.1 
 
 
219 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  31.03 
 
 
238 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  32.18 
 
 
237 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  36.36 
 
 
228 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  32.9 
 
 
239 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  33.5 
 
 
228 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  35.05 
 
 
220 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40339  predicted protein  31.6 
 
 
237 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  34.06 
 
 
232 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  33.48 
 
 
231 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>