More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_40339 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_40339  predicted protein  100 
 
 
237 aa  492  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_5512  predicted protein  52.65 
 
 
250 aa  224  8e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.050444  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01490  conserved hypothetical protein  45.42 
 
 
259 aa  206  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  44.3 
 
 
236 aa  182  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07017  alanine racemase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04300)  46.03 
 
 
272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361048  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  42.56 
 
 
236 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  43.46 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  42.5 
 
 
233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  43.46 
 
 
234 aa  171  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  43.46 
 
 
228 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  43.88 
 
 
233 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  44.35 
 
 
228 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  42.06 
 
 
229 aa  166  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  44.1 
 
 
229 aa  166  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  41 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  41 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  41 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  41 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  41 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  41 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  41 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  41 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  41 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  40.87 
 
 
229 aa  162  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  43.22 
 
 
231 aa  161  7e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  42.55 
 
 
230 aa  161  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  42.73 
 
 
231 aa  161  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  41.95 
 
 
242 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  40 
 
 
231 aa  160  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  40.66 
 
 
234 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  48.06 
 
 
213 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  41.49 
 
 
235 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  44.6 
 
 
228 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  44.07 
 
 
232 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  40.93 
 
 
230 aa  158  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  42.54 
 
 
228 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  41.7 
 
 
230 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  38.7 
 
 
229 aa  157  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  44.6 
 
 
228 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48387  predicted protein  42.86 
 
 
250 aa  157  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.181338 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.25 
 
 
234 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  42.73 
 
 
237 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  43.19 
 
 
241 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  43.29 
 
 
227 aa  156  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  40.25 
 
 
234 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.25 
 
 
234 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  40.25 
 
 
234 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  42.54 
 
 
233 aa  155  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  41.81 
 
 
228 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  44.13 
 
 
228 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  40.69 
 
 
235 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  43.46 
 
 
262 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  43.64 
 
 
229 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  40.79 
 
 
232 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  38.89 
 
 
227 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  37.04 
 
 
235 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  40.53 
 
 
226 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  39.65 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  40.34 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  37.93 
 
 
229 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  40.34 
 
 
244 aa  152  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1069  alanine racemase domain-containing protein  40.42 
 
 
241 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  39.47 
 
 
238 aa  151  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3040  alanine racemase domain-containing protein  40.08 
 
 
232 aa  151  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532898  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  39.43 
 
 
237 aa  151  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 
229 aa  151  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  41.42 
 
 
228 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  36.55 
 
 
255 aa  151  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  41.35 
 
 
232 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  41.35 
 
 
242 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  40.19 
 
 
229 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  40 
 
 
232 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  41.38 
 
 
239 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  42.37 
 
 
231 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  42.98 
 
 
232 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 
239 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  39.91 
 
 
232 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  40.09 
 
 
232 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 
248 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  41.03 
 
 
237 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  39.15 
 
 
235 aa  149  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  38.82 
 
 
238 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  41.77 
 
 
271 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  41.03 
 
 
236 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  43.7 
 
 
257 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4030  alanine racemase domain-containing protein  43.8 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  38.49 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  37.39 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  41.82 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  39.47 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  42.01 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  42.15 
 
 
276 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  40 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  45.37 
 
 
223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  37.97 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  40.66 
 
 
237 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  41.18 
 
 
237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  43.64 
 
 
232 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  43.1 
 
 
280 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  45.85 
 
 
227 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>