More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_48387 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_48387  predicted protein  100 
 
 		 250 aa  513  1.0000000000000001e-145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.181338 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01490  conserved hypothetical protein  50 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07017  alanine racemase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04300)  45.04 
 
 		 272 aa  194  8.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40339  predicted protein  44.13 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  39.41 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  39.41 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  39.92 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_5512  predicted protein  36.11 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.050444  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  40.53 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  39.24 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  37.77 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  37.34 
 
 		 230 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  40.19 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  37.6 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  37.85 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  38.08 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  40.67 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  39.17 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  37.38 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  38.05 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  38.46 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  38.05 
 
 		 238 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  38.05 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  40.97 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  37.83 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  39.91 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  41.59 
 
 		 233 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  37.13 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  38.3 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  38.94 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  41.43 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  40 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  38.63 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  41.51 
 
 		 244 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 239 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  39.17 
 
 		 235 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03298  alanine racemase domain protein  42.45 
 
 		 202 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  37.8 
 
 		 231 aa  131  9e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  37.45 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  39.47 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  40.48 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  40.48 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  37.17 
 
 		 234 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  38.5 
 
 		 222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  40.85 
 
 		 230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  37.5 
 
 		 236 aa  128  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  37.34 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  40.74 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  33.9 
 
 		 231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  36.73 
 
 		 222 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  40.28 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  37.82 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  35.82 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  37.56 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  35.86 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  39.55 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  35.29 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  35.29 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  35.29 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  35.29 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  35.29 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  35.29 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  35.29 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  35.29 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  35.29 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  34.76 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  37.18 
 
 		 237 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  38.79 
 
 		 220 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  37.93 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3040  alanine racemase domain-containing protein  38.6 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  38.72 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  36.74 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  39.82 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  36.53 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  33.9 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  35.98 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  37.39 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  35.17 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  38.02 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  38.52 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01992  hypothetical protein  37.61 
 
 		 230 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  38.1 
 
 		 241 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  37.67 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  37.91 
 
 		 224 aa  121  9e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  34.63 
 
 		 253 aa  121  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1883  alanine racemase domain-containing protein  36.9 
 
 		 238 aa  121  9e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  38.21 
 
 		 229 aa  121  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  36.71 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  36.12 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  36.41 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  36.51 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0125  hypothetical protein  38.67 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  37.96 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  38.68 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  39.34 
 
 		 230 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  36.92 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  35.95 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  35.56 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  35.56 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>