More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1189 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 235 aa  491  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  47.79 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  45.06 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  47.64 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  46.09 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  46.52 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  43.29 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  44.59 
 
 		 231 aa  202  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  48.26 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  43.48 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  44.1 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  41.63 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  47.55 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  41.81 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  47.23 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  43.81 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  43.24 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  46.57 
 
 		 220 aa  188  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  43.72 
 
 		 276 aa  187  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  42.54 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  44 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  43.23 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  44.3 
 
 		 224 aa  186  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  42.08 
 
 		 234 aa  184  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  42.03 
 
 		 219 aa  184  7e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  46.86 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  46.15 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  42.24 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  42.79 
 
 		 270 aa  182  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  45.93 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  40.35 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  45.37 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  42.15 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  41.98 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  45.07 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  43.23 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  43.52 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  41.26 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  41.48 
 
 		 280 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  42.49 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  44.07 
 
 		 242 aa  175  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  41.73 
 
 		 272 aa  174  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  43.81 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  42.17 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  41.48 
 
 		 275 aa  172  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  44.13 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  42.11 
 
 		 233 aa  171  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  39.13 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  44.55 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  40.79 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  42.72 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  42.24 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  41.78 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  44.04 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  40.62 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  41.56 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  42.17 
 
 		 228 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  42.04 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  41.3 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  42.67 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  40.52 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  42.13 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  42.11 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  41.78 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  35.81 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  41.41 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  41.41 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  42.24 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  40.17 
 
 		 237 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  42.92 
 
 		 228 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  39.81 
 
 		 218 aa  164  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  39.65 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  37.61 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  39.83 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  42.54 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  42.45 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  41.09 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  38.63 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  41.74 
 
 		 241 aa  161  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  41.98 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  40.17 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  40.6 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  37.83 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  39.06 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  41.63 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  40.87 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  39.15 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  43.2 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  39.74 
 
 		 244 aa  156  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  46.38 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  40.85 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  41.78 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  42.6 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  37.39 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>