More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3251 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 244 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  83.2 
 
 		 240 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  57.79 
 
 		 242 aa  248  7e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  51.44 
 
 		 248 aa  233  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  47.33 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  45.26 
 
 		 235 aa  191  9e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  44.94 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  44.73 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  47.52 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  45.68 
 
 		 231 aa  184  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  43.9 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  47.06 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  46.77 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  44.17 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  41.98 
 
 		 235 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  41.39 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  44.44 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  47.01 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  41.74 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  43.21 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  45.31 
 
 		 270 aa  174  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  43.33 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  44.58 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  42.31 
 
 		 235 aa  173  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  46.03 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  42.68 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  44.3 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  40.98 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  43.67 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  47.27 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  41.63 
 
 		 229 aa  168  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  45.56 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  43.21 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  44.35 
 
 		 247 aa  165  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  45.31 
 
 		 271 aa  164  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  46.33 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  46.12 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  40.57 
 
 		 233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  46.34 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  46.55 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  43.85 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  40.57 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  40.57 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  44.9 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  40.57 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  44.21 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  41.36 
 
 		 226 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  41.22 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  40.89 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  40.98 
 
 		 239 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  40.6 
 
 		 230 aa  158  7e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  39.42 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  38.43 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  35.77 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  40.73 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  41.63 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  40.27 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  43.27 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  35.51 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  40.16 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  43.44 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  42.15 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  45.08 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  41.6 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  40.82 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  41.6 
 
 		 241 aa  155  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  40.16 
 
 		 232 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  43.75 
 
 		 242 aa  154  9e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  43.27 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  40.57 
 
 		 269 aa  154  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  44.08 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  38.33 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  41.8 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  42.56 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  40.25 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  38.11 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  40.25 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  39.34 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  41.8 
 
 		 228 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  41.2 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  38.46 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  38.71 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  39.75 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  43.85 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  40.16 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  44.21 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  43.37 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  41.7 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  38.87 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  40.16 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  46.12 
 
 		 286 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  41.39 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  37.66 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  37.7 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  44.21 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  39.3 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  40.18 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  38.06 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  38.18 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>