More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1702 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  68.87 
 
 		 212 aa  296  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  49.77 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  44.7 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  47.44 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1426  hypothetical protein  48.87 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955948  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  47.06 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  41.94 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  43.64 
 
 		 227 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  46.55 
 
 		 244 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  45.45 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  42.27 
 
 		 228 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  43.26 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  45.41 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  47.21 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  45.88 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  49.75 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  36.36 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  40.99 
 
 		 234 aa  155  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  44.55 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  43.33 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  38.12 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  42.99 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  43.69 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  46.73 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  44.86 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  43.84 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  45.45 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  41.74 
 
 		 235 aa  151  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  44.76 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  42.99 
 
 		 232 aa  150  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  40.91 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  41.41 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  42.08 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21481  TIM-barrel fold family protein  45.23 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  42.44 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  45.55 
 
 		 199 aa  148  8e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  41.89 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  41.89 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  43.17 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  41.01 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  39.73 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  39.45 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  42.29 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  37.85 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  44.72 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  42.86 
 
 		 261 aa  142  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  42.67 
 
 		 248 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  38.39 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  44.55 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  41.5 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  40.18 
 
 		 226 aa  141  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  35.39 
 
 		 253 aa  141  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  37.95 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  38.42 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  41.71 
 
 		 250 aa  141  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  42.15 
 
 		 237 aa  141  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  37.95 
 
 		 213 aa  141  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  40.18 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  41.52 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  42.31 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  45.24 
 
 		 240 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  45.41 
 
 		 243 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  44.39 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  40.64 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  44.93 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  40.27 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  44 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  37.61 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  45.24 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  41.23 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  38.39 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  45.13 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  40.37 
 
 		 271 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  43.69 
 
 		 242 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  41.18 
 
 		 271 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  35.45 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  41.71 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  44.62 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  45.13 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  42.45 
 
 		 272 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  38.86 
 
 		 213 aa  134  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  41.2 
 
 		 218 aa  134  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  41.4 
 
 		 225 aa  134  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  40.28 
 
 		 247 aa  134  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  36.22 
 
 		 219 aa  134  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  38.79 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  40.99 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  42.79 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  39.81 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  39.15 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  40.19 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  38.99 
 
 		 276 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  39.81 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  39.35 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  43.39 
 
 		 248 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  38.64 
 
 		 217 aa  131  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>