More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0460 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  68.42 
 
 		 228 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  63.6 
 
 		 231 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  66.67 
 
 		 231 aa  298  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  63.16 
 
 		 230 aa  297  7e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  62.28 
 
 		 230 aa  292  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  60.09 
 
 		 237 aa  285  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  58.77 
 
 		 228 aa  266  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  49.78 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  53.12 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  48.26 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  50.22 
 
 		 229 aa  211  7e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  48.21 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  48.23 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  47.41 
 
 		 229 aa  204  9e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  51.75 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  44.93 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  46.05 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  50.22 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  45.81 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  49.12 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  44.78 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  46.55 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  49.13 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  51.77 
 
 		 242 aa  198  7e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  42.17 
 
 		 253 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  44.74 
 
 		 226 aa  197  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  45.65 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  46.96 
 
 		 229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  48.25 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  50 
 
 		 235 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  44.98 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  42.15 
 
 		 224 aa  192  5e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  47.37 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  47.79 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  47.39 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  47.85 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  46.93 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  46.93 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  47.37 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  47.83 
 
 		 238 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  51.46 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  46.88 
 
 		 276 aa  184  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  45.34 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  46.96 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  45.22 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  45.63 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  40.53 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  46.09 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  43.53 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  43.81 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  46.53 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  44.98 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  45.5 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  43.75 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  39.57 
 
 		 219 aa  181  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  44.2 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  47.35 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  43.3 
 
 		 275 aa  181  9.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  46.72 
 
 		 271 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  40.95 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  47.39 
 
 		 241 aa  180  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  44.2 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  44.25 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  46.49 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  45.61 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  45.78 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  44.89 
 
 		 280 aa  178  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  41.56 
 
 		 229 aa  177  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  41.67 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  42.11 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  42.24 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  45.41 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  44.98 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  45.23 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  47.83 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  43.67 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  46.41 
 
 		 248 aa  174  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  43.69 
 
 		 219 aa  174  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  44.05 
 
 		 231 aa  174  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  45.27 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  45.81 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  45.89 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  44.59 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  44.83 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  42.54 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  47.16 
 
 		 257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  42.54 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  43.94 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  42.86 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  47.6 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  44.35 
 
 		 235 aa  171  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  42.11 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  47.16 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  42.67 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  47.16 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1687  alanine racemase domain-containing protein  44.21 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  44.02 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  43.67 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>