More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2910 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 242 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  62.81 
 
 		 248 aa  275  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  61.11 
 
 		 272 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  59 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  54.47 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  45.41 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  53.02 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  48.29 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  49.57 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  49.78 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  51.77 
 
 		 228 aa  198  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  48.29 
 
 		 230 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  45.89 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  48.89 
 
 		 228 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  50.64 
 
 		 237 aa  190  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  47.19 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  50.95 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  50.21 
 
 		 229 aa  185  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  45.92 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  46.75 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  44.07 
 
 		 235 aa  181  8.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  48.71 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  50 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  48.71 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  46.31 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  41.99 
 
 		 230 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  46.55 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  45.38 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  47.19 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  44.3 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  50.22 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  46.35 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  49.57 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  45.45 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  44.54 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  49.29 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  47.14 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  47.6 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  45.19 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  44.59 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  47.62 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  46.67 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  50.22 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  42.55 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  42.92 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  40.77 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  44.83 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  46.67 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  43.72 
 
 		 226 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  42.86 
 
 		 228 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  47.84 
 
 		 223 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  42.49 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  40.6 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  44.59 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  42.55 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  49.35 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  42.49 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  49.57 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  48.31 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  42.49 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  43.75 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  41.25 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  50.65 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  50.65 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  46.34 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  42.49 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  42.02 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  42.42 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  40.35 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  42.06 
 
 		 233 aa  158  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  47.19 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  50.22 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  41.63 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  42.06 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  41.2 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  38.94 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  45.29 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  43.59 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  49.33 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2216  hypothetical protein  39.38 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000309161  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2190  hypothetical cytosolic protein  39.38 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.724398  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  43.36 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2683  hypothetical protein  48.73 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  51.2 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  41.2 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  42.92 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  50.72 
 
 		 232 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  37.28 
 
 		 229 aa  155  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  37.28 
 
 		 229 aa  155  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  45.97 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  41.2 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  43.75 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  34.47 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  43.4 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  40.77 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  46.32 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  34.76 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  42.5 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  42.5 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  42.5 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>