More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3590 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  62.81 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  57.03 
 
 		 272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  55.6 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  54.59 
 
 		 231 aa  199  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  48.48 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  38.46 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  50.21 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  44.44 
 
 		 227 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  47.37 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  45.99 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  50.21 
 
 		 235 aa  171  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  45.61 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  46.3 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  45.96 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  48.6 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  39.5 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  45.99 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  48.51 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  44.02 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  42.44 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  44.68 
 
 		 230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  43.64 
 
 		 237 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  45.92 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  43.4 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  46.98 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  43.22 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  45.69 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  48.31 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  46.33 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  44.49 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  46.33 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  43.46 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  44.96 
 
 		 229 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  47.44 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  43.35 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  41.08 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  44.89 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  46.19 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  42.74 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  45.3 
 
 		 231 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  41.18 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  45.76 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  49.77 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  49.77 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  48.65 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  39.75 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  49.58 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  44.3 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  39.24 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  43.29 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  41.03 
 
 		 228 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  38.82 
 
 		 234 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  42.62 
 
 		 239 aa  151  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  48.36 
 
 		 213 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  44.54 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  38.24 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  44.02 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3702  alanine racemase domain protein  50 
 
 		 237 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  41.49 
 
 		 237 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  45.73 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  45.76 
 
 		 232 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  40.52 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  40.52 
 
 		 242 aa  148  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  40.52 
 
 		 232 aa  148  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  37.97 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  42.44 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  46.47 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2411  hypothetical protein  48.73 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429006  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2598  hypothetical protein  48.73 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.734317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  39.66 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1189  hypothetical protein  48.73 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0328  hypothetical protein  48.73 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2418  hypothetical protein  48.66 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  37.97 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3346  hypothetical protein  49.58 
 
 		 305 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  39.11 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  37.71 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  43.1 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3299  hypothetical protein  48.31 
 
 		 232 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3333  hypothetical protein  48.31 
 
 		 232 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  39.18 
 
 		 229 aa  144  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  41.37 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  41.98 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  42.67 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  41.45 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  41.6 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  38.98 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4030  alanine racemase domain-containing protein  42.13 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  39.18 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  42.17 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  45.53 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  40.91 
 
 		 229 aa  142  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  37.29 
 
 		 231 aa  142  7e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  40.73 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  41.8 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  48.73 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  41.8 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  39.84 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>