More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3131 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  88.89 
 
 		 221 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  88.89 
 
 		 221 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  69.91 
 
 		 218 aa  313  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  71.96 
 
 		 217 aa  311  6.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  67.45 
 
 		 217 aa  294  6e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  63.64 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  60.09 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  61.65 
 
 		 227 aa  246  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  61.03 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  59.72 
 
 		 227 aa  242  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  62.37 
 
 		 225 aa  241  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  63.54 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  59.62 
 
 		 221 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  58.69 
 
 		 228 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  60.09 
 
 		 221 aa  237  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  57.75 
 
 		 224 aa  236  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  54.59 
 
 		 225 aa  234  8e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  57.28 
 
 		 242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  57.21 
 
 		 247 aa  232  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  54.38 
 
 		 247 aa  231  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  59.22 
 
 		 219 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  54.46 
 
 		 244 aa  229  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  55.4 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  56.34 
 
 		 230 aa  227  9e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  54.46 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  54.29 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  54.46 
 
 		 219 aa  225  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  53.92 
 
 		 226 aa  224  9e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  55.96 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  58.33 
 
 		 230 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  55.24 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  61.81 
 
 		 248 aa  221  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  53.52 
 
 		 219 aa  221  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  46.4 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  51.61 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  53.27 
 
 		 250 aa  207  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  59.62 
 
 		 229 aa  203  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  53.44 
 
 		 191 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  50.47 
 
 		 221 aa  201  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  49.77 
 
 		 225 aa  198  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  46.38 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  50.23 
 
 		 220 aa  192  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  43.68 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  45.98 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  43.58 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  46.43 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  47.5 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  40.79 
 
 		 236 aa  158  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  41.1 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  46.67 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  46.67 
 
 		 223 aa  154  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  44.44 
 
 		 232 aa  151  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  39.63 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  43.64 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  39.38 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  47.81 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  38.29 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  43.3 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  45.73 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  41.33 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  39.74 
 
 		 236 aa  148  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  45.58 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  37.73 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  43.3 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  38.01 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  44.55 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  41.92 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  38.12 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  36.94 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  42.08 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  38.36 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 		 234 aa  145  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  39.37 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  45.67 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  44.39 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  36.94 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  36.94 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  46.61 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  37.61 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  41.15 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  36.94 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  45.02 
 
 		 228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  42.67 
 
 		 228 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  40.27 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  38.39 
 
 		 232 aa  144  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  36.52 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  38.53 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  40.89 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  43.32 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  38.26 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  46.67 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  39.56 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  42.99 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  46.26 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  39.56 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  43.81 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  44.55 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  39.56 
 
 		 234 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  39.56 
 
 		 234 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>