More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2856 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  66.67 
 
 		 220 aa  275  6e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  68.06 
 
 		 191 aa  264  7e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  57.14 
 
 		 225 aa  235  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  57.75 
 
 		 224 aa  234  8e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  59.81 
 
 		 227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  61.81 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  56.34 
 
 		 247 aa  232  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  56.34 
 
 		 244 aa  231  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  59.15 
 
 		 221 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  55.4 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  58.22 
 
 		 250 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  55.19 
 
 		 218 aa  228  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  57.75 
 
 		 221 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  57.28 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  55.14 
 
 		 219 aa  223  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  58.79 
 
 		 219 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  52.83 
 
 		 218 aa  221  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  55.71 
 
 		 227 aa  221  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  54.13 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  54.93 
 
 		 232 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  52.51 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  56.54 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  51.82 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  52.8 
 
 		 219 aa  214  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  58.33 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  51.42 
 
 		 217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  47.77 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  52.8 
 
 		 219 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  52.02 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  53.05 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  52.58 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  50.47 
 
 		 220 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  50.22 
 
 		 226 aa  201  9e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  50.47 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  52.38 
 
 		 242 aa  197  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  49.78 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  51.8 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  52.36 
 
 		 214 aa  191  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  52.31 
 
 		 248 aa  191  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  45.24 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  49.52 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  53.74 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  43.86 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  45.5 
 
 		 231 aa  157  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  43.72 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  43.75 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  45.92 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  45.65 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  38.42 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  41.88 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  41.56 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  43.91 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  42.4 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  43.26 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  37.93 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  46.53 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  38.89 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  42.74 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  40.83 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  47.78 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  46.53 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  42.98 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  46.25 
 
 		 242 aa  141  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 237 aa  141  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  37.44 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  41.13 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  41.36 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  37.44 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  37.44 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  35.59 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  44.44 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  44.27 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  41.85 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  41.39 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  40.43 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  42.55 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  41.56 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  41.82 
 
 		 276 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  41.38 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  44.88 
 
 		 231 aa  134  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  40.61 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  40.81 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  39.41 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  39.32 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  42.13 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  46.5 
 
 		 246 aa  132  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  43.19 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  36.84 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  41.47 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  41.18 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  42.73 
 
 		 248 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  34.63 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  37.83 
 
 		 222 aa  131  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  39.82 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  40.89 
 
 		 228 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  36.49 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  43.78 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  44.69 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>