More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1179 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 227 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  51.79 
 
 		 234 aa  238  6.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  50.67 
 
 		 230 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  50.67 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  50.22 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  49.78 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  50.88 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  53.12 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  48.21 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  50 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  52.48 
 
 		 231 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  51.1 
 
 		 235 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  47.33 
 
 		 244 aa  205  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  47.35 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  44.49 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  44.25 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  46.52 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  44.25 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  44.49 
 
 		 275 aa  192  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  46.53 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  45.22 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  44 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  45.58 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  45.98 
 
 		 237 aa  191  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  44.69 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  45.58 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  44.93 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  44.84 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  43.81 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  45.89 
 
 		 242 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  47.72 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  43.82 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  44.05 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  43.5 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  44.05 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  43.5 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  45.45 
 
 		 216 aa  188  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  43.3 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  45.58 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  43.5 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  41.3 
 
 		 244 aa  185  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  49.27 
 
 		 213 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  43.91 
 
 		 236 aa  184  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  43.75 
 
 		 280 aa  184  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  47.24 
 
 		 202 aa  184  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  45.33 
 
 		 229 aa  184  8e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  41.63 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  44.84 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  38.96 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  48.53 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  43.3 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  43.3 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  42.42 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  42.29 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  46.26 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  44.84 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  45.37 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  45.33 
 
 		 246 aa  181  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  43.91 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  41.3 
 
 		 241 aa  179  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  45.37 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  44.78 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  45.37 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  43.36 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  44.44 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  42.73 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  40.93 
 
 		 231 aa  177  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  41.92 
 
 		 232 aa  178  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  44.49 
 
 		 233 aa  177  9e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  44.54 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  44.54 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  42.17 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  44.54 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  46.54 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  44.54 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  44.54 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  44.54 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  44.54 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  42.04 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  43.05 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  43.5 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  44.54 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  44.54 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  47.58 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  44.49 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  41.85 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  44.35 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  43.41 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  43.91 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  41.85 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  43.36 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  43.36 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  46.22 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  43.78 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  42.54 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  42.48 
 
 		 233 aa  175  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  46.15 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2190  hypothetical cytosolic protein  39.65 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.724398  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2216  hypothetical protein  39.65 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000309161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  46.83 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>