More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0433 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  68.06 
 
 		 221 aa  264  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  69.63 
 
 		 220 aa  257  7e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  60.42 
 
 		 221 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  59.38 
 
 		 221 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  59.38 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  59.9 
 
 		 225 aa  221  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  57.29 
 
 		 227 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  58.33 
 
 		 232 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  57.81 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  57.29 
 
 		 224 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  57.81 
 
 		 219 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  57.37 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  56.77 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  55.73 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  53.65 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  55.79 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  52.88 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  57.81 
 
 		 250 aa  209  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  55.26 
 
 		 247 aa  208  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  56.25 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  57.81 
 
 		 219 aa  206  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  53.4 
 
 		 218 aa  205  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  57.51 
 
 		 230 aa  204  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  56.77 
 
 		 219 aa  203  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  55.73 
 
 		 219 aa  202  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  53.44 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  56.77 
 
 		 226 aa  201  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  55.21 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  54.17 
 
 		 242 aa  200  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  56.77 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  56.25 
 
 		 226 aa  198  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  52.91 
 
 		 221 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  51.83 
 
 		 218 aa  197  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  50.53 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  54.69 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  52.91 
 
 		 221 aa  195  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  56.25 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  52.6 
 
 		 248 aa  185  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  54.97 
 
 		 214 aa  184  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  50.79 
 
 		 217 aa  184  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  51.04 
 
 		 226 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  47.92 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  41.05 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  47.06 
 
 		 230 aa  147  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  47.78 
 
 		 230 aa  147  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  46.77 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  45.83 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  45.31 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  43.75 
 
 		 213 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  41.29 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  42.57 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  39 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  42.45 
 
 		 242 aa  135  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  41.71 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  45.83 
 
 		 223 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  43.78 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  41.21 
 
 		 231 aa  132  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  39.5 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  40.57 
 
 		 240 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  42.79 
 
 		 228 aa  131  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  42.79 
 
 		 227 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  39.6 
 
 		 241 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  37 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  45.27 
 
 		 246 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  42.79 
 
 		 234 aa  128  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  41.18 
 
 		 222 aa  127  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  41.29 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  37.31 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0930  alanine racemase domain protein  45.45 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246462  normal  0.758463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  38 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  42.03 
 
 		 244 aa  125  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  39.6 
 
 		 233 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  40.4 
 
 		 238 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  45.02 
 
 		 248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  39.5 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  45.23 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  38.36 
 
 		 244 aa  124  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  43.5 
 
 		 221 aa  123  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  39.41 
 
 		 234 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  38.89 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  42 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  37.13 
 
 		 237 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  44.22 
 
 		 228 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  38.5 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  38.61 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  44.72 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  44.22 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  38.12 
 
 		 235 aa  122  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  38.89 
 
 		 239 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  44.67 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  38.5 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  46.86 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  38.5 
 
 		 232 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  39.9 
 
 		 244 aa  121  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  38.5 
 
 		 232 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  41.71 
 
 		 231 aa  120  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  38.38 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  41.79 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>