More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3257 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 246 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  58.67 
 
 		 247 aa  231  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  59.28 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  54.3 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  56.16 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  54.15 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  50.21 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  55.07 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  52.42 
 
 		 242 aa  188  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  53.97 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  52.88 
 
 		 242 aa  185  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  49.55 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  55.45 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  51.53 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  46.64 
 
 		 346 aa  178  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  50.44 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  47.21 
 
 		 228 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  43.62 
 
 		 319 aa  175  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  48.07 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  58.45 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  48.48 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  45.24 
 
 		 279 aa  168  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  49.78 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  48.92 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  48.93 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  48.51 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  46.75 
 
 		 230 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  46.32 
 
 		 228 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  45.42 
 
 		 275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  43.5 
 
 		 237 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  50.21 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  46.93 
 
 		 228 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  47.92 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  45.85 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  44.77 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  44.73 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  40.08 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  42.19 
 
 		 229 aa  158  9e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  39.17 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  44.16 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  41.56 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  41.25 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  45.76 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  46.06 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  48.33 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  41.25 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  44.16 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  41.07 
 
 		 226 aa  155  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  47.64 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  44.89 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13550  conserved hypothetical protein TIGR00044  50.68 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32989  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  41.25 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  43.36 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  47.81 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  45.73 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  39.82 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  48.25 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  44.68 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  48 
 
 		 223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  48.93 
 
 		 220 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  43.29 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  48.54 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  39.06 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  45.16 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  47.41 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  39.15 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  46.7 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  36.25 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  32.16 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  37.72 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  47.3 
 
 		 221 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  43.33 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  47.72 
 
 		 238 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  37.87 
 
 		 233 aa  148  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  48.28 
 
 		 213 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  45.14 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  37.77 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  40.98 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  44.25 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  33.48 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  44.05 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  39.39 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  42.49 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  38.36 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  37.72 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  46.26 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  46.26 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  48.02 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  38.56 
 
 		 239 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  41.53 
 
 		 241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  38.03 
 
 		 236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  43.23 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  39.24 
 
 		 229 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  41.13 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  38.3 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  44.03 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  46.89 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>