More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12178 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  517  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  59.27 
 
 		 275 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  57.43 
 
 		 279 aa  278  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  61.42 
 
 		 254 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  61.42 
 
 		 254 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  61.42 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  53.04 
 
 		 236 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  48.39 
 
 		 244 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  46.46 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  48.39 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  46.64 
 
 		 248 aa  175  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  43.87 
 
 		 249 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  46.03 
 
 		 240 aa  168  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  44.93 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  45.2 
 
 		 254 aa  162  7e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  40.31 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  45.37 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  42.62 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  46.48 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  41.06 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  43.1 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  40.16 
 
 		 234 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  42.28 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4007  alanine racemase domain-containing protein  41.77 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0551475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  46 
 
 		 238 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  42.6 
 
 		 246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  37.77 
 
 		 346 aa  131  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  32.37 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  33.2 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  35.74 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  34.5 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  32.93 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  32.79 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  36.44 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  32.22 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  35.08 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  35.34 
 
 		 232 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  33.85 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  31.25 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  28.16 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  32.38 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  32.38 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  32.38 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  32.38 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  32.38 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  32.38 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  32.38 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  35.74 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  32.38 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  32.38 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  31.6 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  32.35 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  28.33 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  30.89 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  36.73 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  32.38 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  32.39 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  32.39 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  32.1 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  32.39 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  32.39 
 
 		 271 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  32.39 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  30.86 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  32.64 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  36.13 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  32.77 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  30.45 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  31.17 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  29.29 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  33.6 
 
 		 234 aa  108  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  29.29 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  29.29 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  32.67 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  36.09 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  31.69 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  30.89 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  28.15 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  34.84 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  34.03 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  35.56 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  35.69 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  29.29 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  32.53 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  35.69 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  30 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  31.97 
 
 		 219 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  34.43 
 
 		 223 aa  105  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  33.61 
 
 		 237 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13550  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.6 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32989  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  31.02 
 
 		 227 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  34.12 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  28.8 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  25 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  30.57 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  32.13 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  34.07 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  33.74 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  31.97 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  27.31 
 
 		 233 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  35.51 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>