More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2922 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 244 aa  474  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  69.66 
 
 		 249 aa  311  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  68.64 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  64.22 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  65.65 
 
 		 234 aa  271  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  65.57 
 
 		 242 aa  261  8e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  61.44 
 
 		 244 aa  251  6e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  61.5 
 
 		 234 aa  251  8.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  60.58 
 
 		 245 aa  232  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  55.87 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  60.08 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  57.58 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  55.75 
 
 		 231 aa  225  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  62.82 
 
 		 238 aa  222  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  55.93 
 
 		 244 aa  215  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  53.09 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  56 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  47.74 
 
 		 346 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  42.76 
 
 		 319 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13550  conserved hypothetical protein TIGR00044  50.76 
 
 		 262 aa  178  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32989  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4007  alanine racemase domain-containing protein  51.85 
 
 		 249 aa  175  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0551475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  46.89 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  46.86 
 
 		 275 aa  168  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  45.49 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  48.28 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  46.75 
 
 		 254 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  46.75 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  46.75 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  41.3 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  43.24 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  43.42 
 
 		 228 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  43.44 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  42.24 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  41.85 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  41.89 
 
 		 228 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  42.36 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  42.22 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  42.98 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  35.53 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  43.78 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  32.9 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  42.48 
 
 		 229 aa  141  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  42.98 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  32.89 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  36.64 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  43.18 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  42.98 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  43.81 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  44.04 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  34.2 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  32.6 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  38.43 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  36.4 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  38.96 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  38.43 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.43 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.43 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  41.67 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  37.99 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  37.99 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  37.99 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  37.95 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  37.99 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  37.99 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  37.99 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  37.99 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  38.36 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  37.99 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  37.99 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  38.1 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  39.5 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  36.44 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  40.66 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  40.72 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  38.94 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  42.48 
 
 		 229 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  39.83 
 
 		 244 aa  135  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  37.07 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  40.09 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  37.23 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  39.32 
 
 		 235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  37.83 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  38.05 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  38.16 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  36.4 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  36.4 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  38.93 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  36.84 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  32.61 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  37.95 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  37.29 
 
 		 237 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  35.24 
 
 		 228 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  43.67 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  38.94 
 
 		 259 aa  131  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  29.46 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  33.19 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  39.66 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0268  hypothetical protein  33.62 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  40.34 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>