More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2993 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 279 aa  552  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  74.19 
 
 		 275 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  67.72 
 
 		 254 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  67.32 
 
 		 254 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  67.32 
 
 		 254 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  57.43 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  46.99 
 
 		 244 aa  209  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  51.22 
 
 		 236 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  49.39 
 
 		 231 aa  195  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  47.79 
 
 		 248 aa  191  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  45.93 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  44.53 
 
 		 234 aa  169  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  46.89 
 
 		 244 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  42.11 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  44.9 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  41.87 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  43.97 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  42.37 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  42.68 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  38.62 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  40.49 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  42.63 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  43.11 
 
 		 242 aa  138  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  41.06 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  41.5 
 
 		 240 aa  135  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4007  alanine racemase domain-containing protein  41.56 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0551475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  44.8 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  39.17 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  39.34 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  31.8 
 
 		 236 aa  123  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  32.63 
 
 		 235 aa  122  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  37.45 
 
 		 228 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  28.74 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  36.36 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  39.83 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  31.3 
 
 		 239 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  35 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  33.62 
 
 		 228 aa  119  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  35.37 
 
 		 237 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  35.37 
 
 		 241 aa  118  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  38.1 
 
 		 221 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  34.18 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  34.41 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  34.71 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 		 227 aa  116  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  36.07 
 
 		 228 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  36.44 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  30.43 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  31.6 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  31.76 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  35.12 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  37.29 
 
 		 236 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  30.86 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  35.17 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  35.45 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  34.57 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  34.96 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  33.94 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  28.34 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  32.24 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  32.49 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  35.59 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  32.31 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  29 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  27.57 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  31.22 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  34.52 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  32.5 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  34.26 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  37.66 
 
 		 229 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  32.24 
 
 		 242 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  35.12 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  33.47 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  31.8 
 
 		 241 aa  109  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  27.13 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  31.44 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  32.64 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  36.47 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  32.08 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  27.5 
 
 		 235 aa  108  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  27.98 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  32.67 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  34.13 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  32.65 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  36.33 
 
 		 271 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  33.62 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  37.5 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  37.66 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  35.98 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  34.18 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  33.06 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  31.38 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  35.59 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  30.29 
 
 		 236 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  34.58 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  32.76 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03298  alanine racemase domain protein  32.08 
 
 		 202 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  37.76 
 
 		 235 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  31.54 
 
 		 238 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>