More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3435 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 248 aa  485  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  85.08 
 
 		 248 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  54.51 
 
 		 249 aa  234  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  55.83 
 
 		 234 aa  221  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  53.69 
 
 		 244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  55.04 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  53.91 
 
 		 247 aa  214  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  55.87 
 
 		 244 aa  208  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  51.41 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  56.56 
 
 		 242 aa  201  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  50.4 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  51.07 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  50.84 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  52.89 
 
 		 240 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  52.99 
 
 		 245 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  47.79 
 
 		 279 aa  191  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4007  alanine racemase domain-containing protein  50.2 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0551475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  46.46 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  48.33 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  47.06 
 
 		 346 aa  178  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13550  conserved hypothetical protein TIGR00044  52.21 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32989  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  48.82 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  46.94 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  46.94 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  57.09 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 319 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  46.53 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  51.2 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  47.45 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  42.44 
 
 		 242 aa  148  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  41 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  41.77 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  38.37 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  41.05 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  40.25 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  39.57 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  40.34 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  36.67 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  36.67 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  36.67 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  35.48 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  36.67 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  36.67 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  36.67 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  36.67 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  36.67 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  36.67 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  40.6 
 
 		 235 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  35.48 
 
 		 234 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  41.03 
 
 		 236 aa  131  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  35.48 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  38.46 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  35.48 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  38.6 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  35.48 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  41.59 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  39.66 
 
 		 244 aa  128  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  33.05 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  39.74 
 
 		 237 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  37.45 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  39.33 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  40.51 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  41.18 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  38.14 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  40.27 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  37.77 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  38.22 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  40.77 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  30 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  36.8 
 
 		 228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  37.77 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  38.97 
 
 		 236 aa  125  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  37.3 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  31.22 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  43.04 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  38.87 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  40.65 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  37.55 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  36.64 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  37.24 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  39.33 
 
 		 228 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  30.86 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  36.93 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  32.44 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  38.91 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  36.82 
 
 		 228 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  37.28 
 
 		 221 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  39.92 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  36.68 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  37.61 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  35.47 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3357  alanine racemase domain-containing protein  35.74 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  37.72 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  40.64 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  35.37 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  39.17 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  32.34 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  32.08 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  39.15 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>