More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16520 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  100 
 
 		 254 aa  493  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  53.88 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  50.82 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  49.59 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  53.09 
 
 		 244 aa  198  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  53.33 
 
 		 248 aa  188  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  49.6 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  49.38 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  49.19 
 
 		 234 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  50.22 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  48.82 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  55.56 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  46.37 
 
 		 244 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  47.84 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  45.2 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  46.59 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  45.45 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  45.85 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  48.02 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  40.33 
 
 		 319 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13550  conserved hypothetical protein TIGR00044  47.13 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32989  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  42.19 
 
 		 346 aa  148  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  42.97 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  42.63 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  47.93 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  40.77 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  41.6 
 
 		 234 aa  138  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  38.91 
 
 		 250 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  43.87 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4007  alanine racemase domain-containing protein  44.35 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0551475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  43.87 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  43.87 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  38.72 
 
 		 224 aa  129  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  40.5 
 
 		 228 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  40.53 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  40.41 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  39.67 
 
 		 236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  37.34 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  37.96 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  39.32 
 
 		 225 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  36.78 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  36.78 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  39.33 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  36.78 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  39.92 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0638  alanine racemase domain-containing protein  42.74 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  37.39 
 
 		 219 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  36.78 
 
 		 234 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  41.49 
 
 		 220 aa  125  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  37.19 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  37.19 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  37.19 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  37.19 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  37.19 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  38.62 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  37.19 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  37.19 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  37.7 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  37.19 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  37.19 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  36.78 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  37.55 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  39.83 
 
 		 219 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  42.92 
 
 		 191 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  39.75 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  36.59 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  38.43 
 
 		 228 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  39.32 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  34.75 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  36.89 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  36.82 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  39.27 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  40.34 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  39.32 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  36.95 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  40.09 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  38.5 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  29.92 
 
 		 233 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  38.89 
 
 		 221 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  41.77 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  40.56 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1687  alanine racemase domain-containing protein  39.76 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  31.82 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  40.27 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  37.76 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  39.63 
 
 		 227 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  38.56 
 
 		 219 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  40.65 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  39.91 
 
 		 220 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  35.68 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  29.75 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  35.98 
 
 		 247 aa  118  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  39.07 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  36.67 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  39 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  39.08 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0294  hypothetical protein  32.67 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  36.18 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>