More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1576 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 245 aa  478  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  68.62 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  60.58 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  54.81 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  54.27 
 
 		 249 aa  218  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  52.77 
 
 		 234 aa  218  8.999999999999998e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  52.99 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  54.55 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13550  conserved hypothetical protein TIGR00044  55.51 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  54.39 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  54.13 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  51.48 
 
 		 244 aa  198  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  50.81 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  52.17 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  54.41 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  54.85 
 
 		 238 aa  178  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  49.35 
 
 		 231 aa  178  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  47.84 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  50.64 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  46.56 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4007  alanine racemase domain-containing protein  49.58 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0551475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  44.12 
 
 		 346 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  42.13 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  38.73 
 
 		 319 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  41.49 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  41.46 
 
 		 279 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  44.93 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  41.74 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  41.74 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  41.28 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  38.56 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  36.99 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  38.14 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  38.1 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  37 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  40.87 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  36.64 
 
 		 271 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  34.19 
 
 		 223 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  37.07 
 
 		 271 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  36.86 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  39.56 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  37.93 
 
 		 229 aa  124  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  36.48 
 
 		 228 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  38.98 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  38.14 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  37.77 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  39.57 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  32.03 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  35.59 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  41.38 
 
 		 191 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  35.78 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  37.25 
 
 		 272 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  34.76 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  42.31 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  39.32 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  37.02 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  39.11 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  31.62 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  36.29 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  28.26 
 
 		 231 aa  119  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0930  alanine racemase domain protein  40.91 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246462  normal  0.758463 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  32.89 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  37.34 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  35.44 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  30.77 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  36.89 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  32.5 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  36.93 
 
 		 229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  37.89 
 
 		 220 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  37.89 
 
 		 221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  37.24 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  36.89 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  35.56 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  35.44 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  37.23 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  37.33 
 
 		 221 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  36.93 
 
 		 237 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  36 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  37.71 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  34.76 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  34.78 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  37.93 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  33.04 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  33.19 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  29.61 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  31.44 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  34.32 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  34.33 
 
 		 227 aa  111  8.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  38.54 
 
 		 231 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  35.9 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  32.17 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4030  alanine racemase domain-containing protein  34.45 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  30.04 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  33.62 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3357  alanine racemase domain-containing protein  34.32 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164594 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  32.77 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  32.77 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  37.23 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  34.5 
 
 		 217 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  35.38 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>