More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2641 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 236 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  55 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  55.93 
 
 		 231 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  54.84 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  54.84 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  53.04 
 
 		 258 aa  214  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  52.65 
 
 		 275 aa  214  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  54.44 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  51.63 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  50.84 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  51.5 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  53.33 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  49.36 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  53.33 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  51.49 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  49.79 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  50.67 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  47.06 
 
 		 247 aa  178  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  44.98 
 
 		 254 aa  168  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  50.64 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  46.86 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  48.13 
 
 		 242 aa  161  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  48.28 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  49.52 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4007  alanine racemase domain-containing protein  47.64 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0551475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  39.3 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  50 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  41.2 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  38.79 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  43.35 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  37.92 
 
 		 261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  39.22 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  37.92 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  33.76 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  39.57 
 
 		 271 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  37.18 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  44.74 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  38.82 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.4 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  38.4 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  38.4 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.4 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  39.78 
 
 		 346 aa  141  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  30.74 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  37.13 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  39.13 
 
 		 271 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  42.67 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  37.97 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  30.77 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  38.2 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  42.06 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  37.18 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  37.18 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  37.18 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  37.72 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  37.18 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  37.18 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  37.18 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  37.18 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  37.18 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  37.18 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  39.48 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  40.17 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  38.63 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  41.95 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  32.03 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  39.57 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  34.89 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  39.3 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  38.24 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  41.48 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  34.63 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  41.48 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  37.23 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  36.32 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  41.48 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  34.87 
 
 		 269 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  37.14 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  34.63 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  34.63 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  33.91 
 
 		 230 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  32.49 
 
 		 239 aa  131  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  38.05 
 
 		 228 aa  131  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  34.63 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  41.6 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  39.74 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  32.77 
 
 		 275 aa  129  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  37.66 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  34.63 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  28.4 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  34.63 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  40.09 
 
 		 232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  33.48 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  33.48 
 
 		 232 aa  128  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13550  conserved hypothetical protein TIGR00044  43.05 
 
 		 262 aa  128  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32989  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  33.91 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  33.77 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>