More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2875 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 234 aa  457  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  70.71 
 
 		 249 aa  325  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  62.77 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  65.65 
 
 		 244 aa  263  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  60.25 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  61.32 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  55.84 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  55.46 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  57.56 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  53.78 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  55.26 
 
 		 234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  54.31 
 
 		 242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  54.55 
 
 		 245 aa  207  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  59.57 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  50.84 
 
 		 244 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  51.52 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  56 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  48.12 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  48.77 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  42.72 
 
 		 319 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4007  alanine racemase domain-containing protein  51.08 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0551475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  44.39 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  43.11 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13550  conserved hypothetical protein TIGR00044  49.55 
 
 		 262 aa  158  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  44.76 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  42.04 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0930  alanine racemase domain protein  46.19 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246462  normal  0.758463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  42.51 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  40 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  42.51 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  41.6 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  40.16 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  40.27 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  42.65 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  39.04 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  40.81 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  40.53 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  41.63 
 
 		 219 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  39.09 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  39.09 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  42.53 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  39.3 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  38.6 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  38.6 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  33.77 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.6 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  38.6 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  38.6 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  38.6 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.6 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.6 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  38.6 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  36.56 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  38.6 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  40.53 
 
 		 228 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  38.6 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.6 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  38.6 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  35.87 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  32.33 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  39.66 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  41.63 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  38.63 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  44.39 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  41.2 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  40.96 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  35.29 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  38.57 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  39.11 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  39.55 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  38.72 
 
 		 241 aa  138  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  40.71 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  36.64 
 
 		 239 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  43.1 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  31.13 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  40.64 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  37 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  40.37 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  37.07 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  40 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  39.73 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  37.95 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  35.96 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  44.64 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  41.31 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  43.95 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  32.6 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  40.56 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  32.44 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  40.56 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3357  alanine racemase domain-containing protein  39.04 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164594 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  36.12 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  38.16 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  34.36 
 
 		 236 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  39.73 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  39.73 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  35.59 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  33.77 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  40.27 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  35.68 
 
 		 227 aa  134  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>