More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3194 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 238 aa  451  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  62.07 
 
 		 249 aa  258  8e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  63.64 
 
 		 244 aa  245  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  58.87 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  59.57 
 
 		 234 aa  231  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  56.49 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  57.69 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  57.83 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  56.28 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  55.7 
 
 		 242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  57.82 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  58.3 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  51.95 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  50.62 
 
 		 244 aa  204  9e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  54.81 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  55.56 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  59.2 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  50 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  46 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  44.4 
 
 		 279 aa  168  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  51.24 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  46.31 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4007  alanine racemase domain-containing protein  49.15 
 
 		 249 aa  158  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0551475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  43.57 
 
 		 346 aa  158  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  46.59 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  46.59 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  46.59 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13550  conserved hypothetical protein TIGR00044  50.47 
 
 		 262 aa  154  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32989  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  44.49 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  39.41 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  37.87 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  43.75 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  38.98 
 
 		 270 aa  148  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  43.17 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  42.29 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  39.48 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  39.41 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  37.45 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  42.73 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  38.96 
 
 		 276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  40.35 
 
 		 228 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  43.93 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  39.39 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  35.17 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  42.73 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  41.08 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  37.87 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  41.81 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  37.91 
 
 		 222 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  39.04 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  41.99 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  39.47 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  41.9 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  40.44 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  40.25 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  40.08 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  33.47 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  41.07 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  37.34 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  41.23 
 
 		 218 aa  134  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  41.23 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  36.48 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  35.5 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  41.1 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  40.08 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  38.03 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  40.79 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  39.47 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  39.48 
 
 		 231 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  30.9 
 
 		 235 aa  131  6.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  39.48 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  43.37 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  29.96 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  32.89 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  37.87 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  42.51 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  38.52 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  38.84 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  39.22 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  32.59 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2683  hypothetical protein  42.32 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  40.43 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  35.55 
 
 		 222 aa  128  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  41.38 
 
 		 232 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  33.78 
 
 		 244 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  42.19 
 
 		 238 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  33.48 
 
 		 232 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  34.96 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  30 
 
 		 231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  33.48 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  33.49 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  33.63 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  35.56 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  34.15 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  35.37 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  41.43 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  35.74 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>