More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3518 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 275 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  74.19 
 
 		 279 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  68.13 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  67.73 
 
 		 254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  67.73 
 
 		 254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  59.27 
 
 		 258 aa  273  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  48.4 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  52.65 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  49.79 
 
 		 231 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  48.33 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  50.21 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  46.94 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  50.82 
 
 		 259 aa  166  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  44.67 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  43.44 
 
 		 247 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  46.48 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  43.15 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  43.98 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  43.98 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  44.16 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  40.08 
 
 		 346 aa  142  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  42.97 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4007  alanine racemase domain-containing protein  43.33 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0551475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  41.49 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  42.99 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  42.68 
 
 		 240 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  40.76 
 
 		 248 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  37.34 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  44.29 
 
 		 238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  33.19 
 
 		 239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  37.04 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  38.75 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  31.86 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  35.39 
 
 		 244 aa  123  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  33.62 
 
 		 232 aa  123  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  32.61 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  37.76 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03298  alanine racemase domain protein  36.84 
 
 		 202 aa  122  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  37.45 
 
 		 241 aa  122  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  40.08 
 
 		 232 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  39.42 
 
 		 232 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  35.86 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  34.6 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  36.82 
 
 		 259 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  32.74 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  33.48 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  35.42 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  38.96 
 
 		 221 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  37.34 
 
 		 230 aa  118  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  33.2 
 
 		 280 aa  118  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  39.08 
 
 		 229 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  36.87 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  31.62 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  36.44 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  29.55 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  39.48 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  30 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  32.17 
 
 		 228 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  33.6 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  37.28 
 
 		 228 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  32.92 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  32.74 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  33.92 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  28.63 
 
 		 231 aa  116  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  35.68 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  36.86 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  38.77 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  37.28 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  36.13 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  32.73 
 
 		 233 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  33.04 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  33.19 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  30.43 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  33.19 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48387  predicted protein  30.59 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.181338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  36.44 
 
 		 238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  38.2 
 
 		 236 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  36.65 
 
 		 235 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  35.51 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  39.11 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  35.74 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  37.44 
 
 		 220 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  33.19 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  31.38 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  32.17 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  35.19 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  40.09 
 
 		 235 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  30.38 
 
 		 237 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01992  hypothetical protein  38.14 
 
 		 230 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  34.85 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  28.63 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  33.18 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  35.54 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  34.3 
 
 		 231 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  28.81 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  30.04 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  36.67 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>