More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0498 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 235 aa  466  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  43.24 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  42.66 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  47.71 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  47.01 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  46.54 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  43.29 
 
 		 270 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  46.79 
 
 		 230 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  47.19 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  47.44 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  44.35 
 
 		 235 aa  169  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  45.91 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  50 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  41.18 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  45.41 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  45.69 
 
 		 271 aa  164  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  41.13 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  40.55 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  43.6 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  42.67 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  45.1 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  44.04 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  38.91 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  36.12 
 
 		 235 aa  157  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  44.39 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  36.07 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  40.81 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  42.13 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  39.73 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  44.5 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  43.84 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  41.33 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  44.93 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  43.07 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  41.82 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  35.81 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  41.59 
 
 		 275 aa  152  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  40.16 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  38.2 
 
 		 261 aa  151  8e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  44.76 
 
 		 214 aa  151  8.999999999999999e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  38.76 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  42.01 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  37.77 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  38.76 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  45.97 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  40.89 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  44.5 
 
 		 241 aa  148  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  39.64 
 
 		 229 aa  148  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  36.1 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  43.84 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  35.24 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  38.61 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  42.25 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  42.72 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  36.95 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  34.88 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  43.44 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  39.11 
 
 		 271 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  38.76 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  39.57 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  40.59 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  41.26 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  41.55 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  41.81 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  39.56 
 
 		 259 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  42.17 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0930  alanine racemase domain protein  45.75 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246462  normal  0.758463 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  39.63 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  37.33 
 
 		 271 aa  141  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  42.99 
 
 		 230 aa  141  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  42.06 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  40.72 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  39.81 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  44.81 
 
 		 221 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  38.5 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  41.46 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  43.11 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  40.29 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  38.03 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  40.37 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  41.46 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  41.41 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  40.71 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  36.95 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  37.04 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  39.04 
 
 		 229 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  41.46 
 
 		 228 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  41.3 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  42.36 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01992  hypothetical protein  46.8 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.87 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  39.01 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  40.18 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  37.5 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  41.89 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  40.95 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  40.68 
 
 		 238 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  43.2 
 
 		 212 aa  135  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  38.18 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>