More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2025 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  66.83 
 
 		 199 aa  264  8e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21481  TIM-barrel fold family protein  63.81 
 
 		 225 aa  261  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  59.07 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  55.84 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  55.33 
 
 		 213 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  50.76 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  48.08 
 
 		 211 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  47.72 
 
 		 211 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04451  TIM-barrel fold family protein  48.68 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.344267  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  49.54 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  43.84 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  43.35 
 
 		 224 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  40.72 
 
 		 222 aa  157  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  45.88 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  45.79 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  41.44 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  42.4 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  40.72 
 
 		 222 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  47.5 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  40.72 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  46.98 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  44.39 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  41.38 
 
 		 241 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  38.12 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  44.39 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  42.23 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  44.39 
 
 		 228 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  43.93 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  42.03 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  43.9 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  40.7 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  41.74 
 
 		 236 aa  144  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  41.98 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  45.45 
 
 		 235 aa  144  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  43.35 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  42.31 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  43.14 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  42.78 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  46.31 
 
 		 246 aa  141  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  43.54 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  40.95 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  43.33 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  37.5 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  41.62 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  42.65 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  41.45 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  41.63 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  44.6 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  43.07 
 
 		 231 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  39.45 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 223 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  37.81 
 
 		 225 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  42.36 
 
 		 235 aa  137  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  44.02 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  40.28 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  41.59 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  41.09 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  42.99 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  35.16 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  43.13 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  41.55 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  39.38 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  40.95 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  33.66 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  39.71 
 
 		 226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  41.67 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  40.91 
 
 		 248 aa  134  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  41.09 
 
 		 234 aa  134  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  41.18 
 
 		 228 aa  134  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  44.08 
 
 		 242 aa  134  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  39.71 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  39.02 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  42.11 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  40.45 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  43.13 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  43.13 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  41.87 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  43.14 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  40.1 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  40.1 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  39.59 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  42.11 
 
 		 257 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  40.2 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  42.13 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  37.14 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  39.41 
 
 		 219 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  40.2 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  36.71 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  44.61 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  36.18 
 
 		 234 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  40.59 
 
 		 229 aa  131  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  38.36 
 
 		 244 aa  131  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  37.33 
 
 		 220 aa  131  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  40.87 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2418  hypothetical protein  44.17 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  40.1 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  34 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>