More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_04141 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  90.48 
 
 		 211 aa  390  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04451  TIM-barrel fold family protein  93.12 
 
 		 190 aa  357  8e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.344267  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  72.38 
 
 		 212 aa  310  7.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21481  TIM-barrel fold family protein  51.21 
 
 		 225 aa  232  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  53.17 
 
 		 213 aa  225  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  53.66 
 
 		 213 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  53.12 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  48.08 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  53.09 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  39.71 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  42.58 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  42.11 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  40.95 
 
 		 219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  39.35 
 
 		 228 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  38.21 
 
 		 222 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  36.49 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  38.57 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  38.1 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  42.71 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  42 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  39.9 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  38.24 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  37.14 
 
 		 232 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  41 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  41.41 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  41 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  39.71 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  37.19 
 
 		 229 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  34.34 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  40.5 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  37.56 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  40.5 
 
 		 228 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  41 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  34.55 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  42.51 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  37.62 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  36.27 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  42.03 
 
 		 231 aa  131  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  36.24 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2418  hypothetical protein  39.11 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  33.66 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  36.27 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  36.27 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  38.92 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  36.27 
 
 		 257 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  38.35 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  35.78 
 
 		 268 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  41.79 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  36.71 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  34.16 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  39.32 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  40.5 
 
 		 230 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  36.41 
 
 		 212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  35.29 
 
 		 232 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  37.81 
 
 		 235 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  37.86 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  34.93 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  39.3 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  34.16 
 
 		 223 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  38.46 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  37.75 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  34.63 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  34.86 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  36.57 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  36.89 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  33.48 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  37.31 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  37.02 
 
 		 233 aa  124  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  35.43 
 
 		 235 aa  124  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  36.89 
 
 		 229 aa  124  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  36.36 
 
 		 237 aa  124  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  39.52 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  38.05 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  36.59 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  34.6 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  36.41 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  35.05 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  35.14 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  35.92 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  36.41 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  37.33 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  35.64 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  35.05 
 
 		 232 aa  121  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  35.92 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  31.92 
 
 		 218 aa  121  9e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  35.27 
 
 		 229 aa  121  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2655  alanine racemase domain-containing protein  35.44 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  36.41 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  36.1 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  36.28 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  36.41 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  37.38 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  35.61 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  36.89 
 
 		 237 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  36.59 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  36.82 
 
 		 230 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  37.02 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>