More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1763 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 231 aa  472  1e-132  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  50.66 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  50.66 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  48.05 
 
 		 230 aa  208  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  48.9 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  48.09 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  49.78 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  48.03 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  42.54 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  47.11 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  47.23 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  48.46 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  51.26 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  41.43 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  46.96 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  50 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  44.35 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  43.75 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  45.58 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  46.7 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  48.28 
 
 		 219 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  47.83 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  46.05 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  46.7 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  41.99 
 
 		 216 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  48.25 
 
 		 232 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  44 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  45.02 
 
 		 244 aa  179  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  46.93 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  44.64 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  47.56 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  50 
 
 		 235 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  45.65 
 
 		 229 aa  178  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  46.72 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  47.79 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  45.37 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  43.53 
 
 		 236 aa  174  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  46.55 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  49.3 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  44.54 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  47.85 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  49.3 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  45.18 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  46.54 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  46.49 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  45.61 
 
 		 238 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  45.41 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  41.15 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  46.64 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  41.74 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  45.53 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  43.1 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  45.61 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  44.93 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  44.3 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  42.55 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  45.02 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  46.02 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  42.11 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  44.55 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  43.23 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  46.64 
 
 		 242 aa  168  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  46.76 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  44 
 
 		 272 aa  168  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  45.65 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  45.13 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  43.1 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  44.35 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  45.81 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  45.18 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  39.38 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  43.23 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  47.03 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  42.08 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  45.67 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  45.49 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  45.67 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  46.23 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  46.43 
 
 		 220 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  45.58 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  40.69 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  45.19 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  42.73 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  42.73 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  47.57 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  45.65 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  44.07 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  43.48 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  42.6 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  43.93 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  39.44 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  40.89 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  43.72 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  41.7 
 
 		 269 aa  162  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  40.27 
 
 		 227 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  40.45 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  44.84 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  42.79 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>