More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4249 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  91.78 
 
 		 219 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  81.28 
 
 		 219 aa  356  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  76.71 
 
 		 219 aa  344  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  74.77 
 
 		 225 aa  322  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  75.59 
 
 		 226 aa  318  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  75.59 
 
 		 226 aa  316  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  73.71 
 
 		 250 aa  301  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  65.26 
 
 		 221 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  61.97 
 
 		 219 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  65.26 
 
 		 232 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  63.85 
 
 		 228 aa  271  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  62.91 
 
 		 221 aa  270  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  63.85 
 
 		 225 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  61.5 
 
 		 224 aa  266  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  58.6 
 
 		 226 aa  263  2e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  59.36 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  62.62 
 
 		 219 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  60.93 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  60.95 
 
 		 227 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  60.47 
 
 		 230 aa  252  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  59.15 
 
 		 244 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  57.28 
 
 		 247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  58.74 
 
 		 227 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  56.81 
 
 		 247 aa  244  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  57.34 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  56.81 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  62.69 
 
 		 230 aa  241  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  64.25 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  57.28 
 
 		 218 aa  234  7e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  55.4 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  54.59 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  55.4 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  55.4 
 
 		 218 aa  228  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  52.58 
 
 		 217 aa  219  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  49.05 
 
 		 225 aa  217  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  55.87 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  55.4 
 
 		 221 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  55.5 
 
 		 220 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  52.8 
 
 		 221 aa  208  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  56.77 
 
 		 191 aa  203  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  54.4 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  53.52 
 
 		 229 aa  187  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  46.55 
 
 		 231 aa  174  7e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  40.64 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  51.02 
 
 		 213 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  42.54 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  42.6 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  42.22 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  43.84 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  46.09 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  42.22 
 
 		 233 aa  151  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  41.92 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  41.3 
 
 		 236 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  46.43 
 
 		 227 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  41.96 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  42.15 
 
 		 227 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  42.41 
 
 		 228 aa  148  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  42.61 
 
 		 237 aa  147  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  40.97 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  45.85 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  46.46 
 
 		 257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  40.81 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  40.43 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  44 
 
 		 238 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  42.17 
 
 		 235 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  42.6 
 
 		 238 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  45.02 
 
 		 229 aa  144  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  42.15 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  40.71 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  45.13 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  44 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  41.7 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  41.7 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  40.89 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  41.7 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  43.78 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  41.7 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  42.73 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  41.26 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  40.44 
 
 		 242 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  41.26 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  39.65 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  40.44 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  41.7 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  41.26 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  43.04 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  42.79 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  40.36 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  40.98 
 
 		 216 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  43.18 
 
 		 237 aa  138  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  41.3 
 
 		 230 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  42.24 
 
 		 246 aa  138  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  38.94 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 241 aa  138  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  37.95 
 
 		 243 aa  137  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  42.92 
 
 		 232 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  39.13 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  39.57 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>