More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6110 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 244 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  69.55 
 
 		 243 aa  348  4e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  55.23 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  55.14 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  50.62 
 
 		 275 aa  244  8e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  48.13 
 
 		 257 aa  218  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  47.56 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  46.09 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  48.88 
 
 		 271 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  47.9 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  47.3 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  47.54 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  44.96 
 
 		 262 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  48.48 
 
 		 271 aa  198  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  47.19 
 
 		 261 aa  198  6e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  46.88 
 
 		 276 aa  195  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  45.89 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  43.68 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  44.2 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  42.6 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  47.14 
 
 		 249 aa  181  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  49.56 
 
 		 283 aa  181  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  42.73 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  44.69 
 
 		 237 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  43.11 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  42.73 
 
 		 228 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2378  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  39.47 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  42.73 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  42.17 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  42.04 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  41.41 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  40.87 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  42.42 
 
 		 226 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  42.98 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  44.74 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  42.11 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  44.74 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  42.16 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  40.87 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  39.56 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  42.08 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  39.01 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  42.79 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  41.3 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  43.42 
 
 		 229 aa  158  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  39.65 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  43.17 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  39.66 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  40.79 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  39.66 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  40.53 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  41.55 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  40.61 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  42.24 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  41.56 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  38.7 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  40.17 
 
 		 242 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  41.41 
 
 		 202 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  40.26 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  38.94 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  37.1 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  41.13 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1178  alanine racemase domain protein  38.24 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  normal  0.161066 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  38.05 
 
 		 224 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  41.56 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  46.88 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1222  hypothetical protein  38 
 
 		 271 aa  150  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  39.11 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10850  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.36 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.384201  normal  0.913003 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  39.65 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  40.35 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  40.09 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  39.65 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  39.46 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  39.47 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  40.44 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  39.11 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  43.53 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08000  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  44.7 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0412796  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  40.71 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  40.69 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  38.79 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  36.56 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  41.3 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  42.17 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  39.11 
 
 		 224 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  39.11 
 
 		 224 aa  148  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  39.11 
 
 		 224 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  39.11 
 
 		 224 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  39.11 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3702  alanine racemase domain protein  46.34 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  39.11 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  34.91 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  38.79 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  38.67 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  37.66 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>