More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08000 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_08000  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  100 
 
 		 252 aa  488  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0412796  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  42.74 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  40.34 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  43.97 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  44.4 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  45 
 
 		 262 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  41.38 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  45.8 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  42.68 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2378  alanine racemase domain protein  47.08 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  43.75 
 
 		 257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  45.11 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  39.41 
 
 		 234 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  43.22 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  44.78 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  46.26 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  41.63 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  43.1 
 
 		 246 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  43.23 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  44.35 
 
 		 244 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  37.93 
 
 		 229 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  37.93 
 
 		 229 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  43.58 
 
 		 249 aa  144  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  40.27 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  47.21 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1222  hypothetical protein  43.03 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  44.16 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1699  alanine racemase domain protein  41.06 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.021514 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  35.32 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  37.45 
 
 		 229 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  38.14 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  36.6 
 
 		 235 aa  139  6e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0088  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.82 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  36.13 
 
 		 233 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  38.1 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  38.12 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  40.51 
 
 		 230 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1178  alanine racemase domain protein  43.21 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  normal  0.161066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  39.32 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  38.53 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  36.71 
 
 		 229 aa  131  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  39.57 
 
 		 237 aa  131  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  37.55 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  38.8 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  38.82 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  43.53 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  39.11 
 
 		 225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  38.72 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  44.98 
 
 		 223 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  44.98 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  34.87 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  36.12 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  39.33 
 
 		 272 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  38.22 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  35.93 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  34.73 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  39.15 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10850  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  42.73 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.384201  normal  0.913003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  48.51 
 
 		 283 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  44.44 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  38.46 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  35.98 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  43.02 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  40.48 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  40.08 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  44.5 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  34.76 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  37.82 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  35.71 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  37.24 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  33.19 
 
 		 230 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  36.44 
 
 		 233 aa  122  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  44.73 
 
 		 232 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  41.71 
 
 		 240 aa  121  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  45.15 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  31.49 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  43.09 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  39.34 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  42.08 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  42.42 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2418  hypothetical protein  45 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  35.15 
 
 		 229 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  41.03 
 
 		 237 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  39.32 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  35.42 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  38.53 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  37.08 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  38.66 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  41.2 
 
 		 241 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  40.55 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  38.89 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  34.19 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  40.43 
 
 		 236 aa  118  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  36.05 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  30.89 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  39.92 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  39.82 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  38.82 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>